Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGB3BPQ13352 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGB3BPQ13352 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGB3BPQ13352 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGB3BPQ13352 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGB3BPQ13352 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGB3BPQ13352 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGB3BPQ13352 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGB3BPQ13352 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGB3BPQ13352 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGB3BPQ13352 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGB3BPQ13352 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGB3BPQ13352 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGB3BPQ13352 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGB3BPQ13352 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGB3BPQ13352 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGB3BPQ13352 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGB3BPQ13352 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGB3BPQ13352 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGB3BPQ13352 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGB3BPQ13352 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGB3BPQ13352 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGB3BPQ13352 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGB3BPQ13352 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGB3BPQ13352 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGB3BPQ13352 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGB3BPQ13352 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGB3BPQ13352 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGB3BPQ13352 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGB3BPQ13352 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGB3BPQ13352 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGB3BPQ13352 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGB3BPQ13352 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGB3BPQ13352 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGB3BPQ13352 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGB3BPQ13352 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGB3BPQ13352 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGB3BPQ13352 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGB3BPQ13352 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGB3BPQ13352 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGB3BPQ13352 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGB3BPQ13352 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ITGB3BPQ13352 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ITGB3BPQ13352 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ITGB3BPQ13352 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ITGB3BPQ13352 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGB3BPQ13352 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGB3BPQ13352 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGB3BPQ13352 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGB3BPQ13352 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGB3BPQ13352 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGB3BPQ13352 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGB3BPQ13352 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGB3BPQ13352 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGB3BPQ13352 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGB3BPQ13352 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGB3BPQ13352 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGB3BPQ13352 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGB3BPQ13352 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGB3BPQ13352 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGB3BPQ13352 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGB3BPQ13352 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGB3BPQ13352 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGB3BPQ13352 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGB3BPQ13352 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGB3BPQ13352 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGB3BPQ13352 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGB3BPQ13352 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGB3BPQ13352 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGB3BPQ13352 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGB3BPQ13352 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGB3BPQ13352 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGB3BPQ13352 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGB3BPQ13352 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGB3BPQ13352 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGB3BPQ13352 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGB3BPQ13352 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGB3BPQ13352 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGB3BPQ13352 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGB3BPQ13352 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGB3BPQ13352 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGB3BPQ13352 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGB3BPQ13352 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGB3BPQ13352 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGB3BPQ13352 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGB3BPQ13352 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGB3BPQ13352 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGB3BPQ13352 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGB3BPQ13352 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGB3BPQ13352 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGB3BPQ13352 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGB3BPQ13352 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGB3BPQ13352 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGB3BPQ13352 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGB3BPQ13352 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGB3BPQ13352 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGB3BPQ13352 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGB3BPQ13352 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGB3BPQ13352 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGB3BPQ13352 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms