Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCGB2A2Q13296 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCGB2A2Q13296 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCGB2A2Q13296 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
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SCGB2A2Q13296 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
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SCGB2A2Q13296 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
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