Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms