Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPA4Q13156 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPA4Q13156 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
RPA4Q13156 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPA4Q13156 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPA4Q13156 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPA4Q13156 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPA4Q13156 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPA4Q13156 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPA4Q13156 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPA4Q13156 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPA4Q13156 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
RPA4Q13156 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPA4Q13156 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPA4Q13156 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPA4Q13156 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPA4Q13156 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPA4Q13156 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPA4Q13156 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPA4Q13156 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPA4Q13156 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPA4Q13156 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPA4Q13156 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPA4Q13156 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPA4Q13156 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPA4Q13156 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPA4Q13156 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPA4Q13156 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPA4Q13156 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
RPA4Q13156 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
RPA4Q13156 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPA4Q13156 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPA4Q13156 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPA4Q13156 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPA4Q13156 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
RPA4Q13156 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPA4Q13156 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPA4Q13156 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPA4Q13156 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPA4Q13156 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPA4Q13156 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPA4Q13156 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPA4Q13156 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPA4Q13156 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPA4Q13156 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
RPA4Q13156 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPA4Q13156 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPA4Q13156 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPA4Q13156 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPA4Q13156 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPA4Q13156 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPA4Q13156 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPA4Q13156 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPA4Q13156 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPA4Q13156 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPA4Q13156 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPA4Q13156 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPA4Q13156 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPA4Q13156 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPA4Q13156 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPA4Q13156 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPA4Q13156 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPA4Q13156 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPA4Q13156 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPA4Q13156 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPA4Q13156 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPA4Q13156 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPA4Q13156 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPA4Q13156 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPA4Q13156 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
RPA4Q13156 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
RPA4Q13156 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPA4Q13156 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPA4Q13156 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPA4Q13156 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPA4Q13156 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPA4Q13156 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPA4Q13156 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RPA4Q13156 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RPA4Q13156 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RPA4Q13156 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RPA4Q13156 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPA4Q13156 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPA4Q13156 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPA4Q13156 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPA4Q13156 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPA4Q13156 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPA4Q13156 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPA4Q13156 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPA4Q13156 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPA4Q13156 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPA4Q13156 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPA4Q13156 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPA4Q13156 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPA4Q13156 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPA4Q13156 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RPA4Q13156 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPA4Q13156 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPA4Q13156 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPA4Q13156 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
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