Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CALCOCO2Q13137 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CALCOCO2Q13137 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CALCOCO2Q13137 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CALCOCO2Q13137 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CALCOCO2Q13137 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CALCOCO2Q13137 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CALCOCO2Q13137 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CALCOCO2Q13137 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CALCOCO2Q13137 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CALCOCO2Q13137 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CALCOCO2Q13137 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CALCOCO2Q13137 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CALCOCO2Q13137 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CALCOCO2Q13137 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CALCOCO2Q13137 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CALCOCO2Q13137 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CALCOCO2Q13137 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CALCOCO2Q13137 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CALCOCO2Q13137 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CALCOCO2Q13137 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CALCOCO2Q13137 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CALCOCO2Q13137 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CALCOCO2Q13137 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CALCOCO2Q13137 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CALCOCO2Q13137 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CALCOCO2Q13137 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CALCOCO2Q13137 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CALCOCO2Q13137 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CALCOCO2Q13137 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CALCOCO2Q13137 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CALCOCO2Q13137 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CALCOCO2Q13137 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CALCOCO2Q13137 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CALCOCO2Q13137 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CALCOCO2Q13137 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CALCOCO2Q13137 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CALCOCO2Q13137 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CALCOCO2Q13137 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CALCOCO2Q13137 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CALCOCO2Q13137 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CALCOCO2Q13137 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CALCOCO2Q13137 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CALCOCO2Q13137 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CALCOCO2Q13137 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CALCOCO2Q13137 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CALCOCO2Q13137 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CALCOCO2Q13137 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CALCOCO2Q13137 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CALCOCO2Q13137 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CALCOCO2Q13137 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CALCOCO2Q13137 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CALCOCO2Q13137 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CALCOCO2Q13137 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CALCOCO2Q13137 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CALCOCO2Q13137 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CALCOCO2Q13137 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CALCOCO2Q13137 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CALCOCO2Q13137 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CALCOCO2Q13137 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CALCOCO2Q13137 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CALCOCO2Q13137 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CALCOCO2Q13137 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CALCOCO2Q13137 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CALCOCO2Q13137 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CALCOCO2Q13137 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CALCOCO2Q13137 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CALCOCO2Q13137 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CALCOCO2Q13137 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CALCOCO2Q13137 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CALCOCO2Q13137 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CALCOCO2Q13137 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CALCOCO2Q13137 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CALCOCO2Q13137 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CALCOCO2Q13137 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CALCOCO2Q13137 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CALCOCO2Q13137 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CALCOCO2Q13137 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CALCOCO2Q13137 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CALCOCO2Q13137 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CALCOCO2Q13137 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CALCOCO2Q13137 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CALCOCO2Q13137 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CALCOCO2Q13137 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CALCOCO2Q13137 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CALCOCO2Q13137 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CALCOCO2Q13137 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CALCOCO2Q13137 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CALCOCO2Q13137 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CALCOCO2Q13137 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CALCOCO2Q13137 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CALCOCO2Q13137 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CALCOCO2Q13137 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CALCOCO2Q13137 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CALCOCO2Q13137 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CALCOCO2Q13137 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CALCOCO2Q13137 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CALCOCO2Q13137 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CALCOCO2Q13137 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CALCOCO2Q13137 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
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