Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NR1H3Q13133 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NR1H3Q13133 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NR1H3Q13133 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NR1H3Q13133 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NR1H3Q13133 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NR1H3Q13133 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NR1H3Q13133 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NR1H3Q13133 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NR1H3Q13133 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NR1H3Q13133 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NR1H3Q13133 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NR1H3Q13133 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NR1H3Q13133 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NR1H3Q13133 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NR1H3Q13133 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NR1H3Q13133 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NR1H3Q13133 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NR1H3Q13133 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NR1H3Q13133 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NR1H3Q13133 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NR1H3Q13133 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NR1H3Q13133 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NR1H3Q13133 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NR1H3Q13133 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NR1H3Q13133 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NR1H3Q13133 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NR1H3Q13133 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NR1H3Q13133 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NR1H3Q13133 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NR1H3Q13133 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NR1H3Q13133 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NR1H3Q13133 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NR1H3Q13133 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NR1H3Q13133 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NR1H3Q13133 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NR1H3Q13133 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NR1H3Q13133 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NR1H3Q13133 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NR1H3Q13133 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NR1H3Q13133 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NR1H3Q13133 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NR1H3Q13133 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NR1H3Q13133 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NR1H3Q13133 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NR1H3Q13133 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NR1H3Q13133 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NR1H3Q13133 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NR1H3Q13133 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NR1H3Q13133 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NR1H3Q13133 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NR1H3Q13133 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NR1H3Q13133 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NR1H3Q13133 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NR1H3Q13133 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NR1H3Q13133 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NR1H3Q13133 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NR1H3Q13133 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NR1H3Q13133 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NR1H3Q13133 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NR1H3Q13133 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NR1H3Q13133 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NR1H3Q13133 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NR1H3Q13133 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NR1H3Q13133 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NR1H3Q13133 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NR1H3Q13133 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NR1H3Q13133 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NR1H3Q13133 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NR1H3Q13133 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NR1H3Q13133 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NR1H3Q13133 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NR1H3Q13133 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NR1H3Q13133 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NR1H3Q13133 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NR1H3Q13133 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NR1H3Q13133 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NR1H3Q13133 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NR1H3Q13133 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NR1H3Q13133 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NR1H3Q13133 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NR1H3Q13133 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NR1H3Q13133 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NR1H3Q13133 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NR1H3Q13133 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NR1H3Q13133 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NR1H3Q13133 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NR1H3Q13133 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NR1H3Q13133 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NR1H3Q13133 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NR1H3Q13133 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NR1H3Q13133 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NR1H3Q13133 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NR1H3Q13133 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NR1H3Q13133 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NR1H3Q13133 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NR1H3Q13133 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NR1H3Q13133 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NR1H3Q13133 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NR1H3Q13133 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms