Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAF1Q13077 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAF1Q13077 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAF1Q13077 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAF1Q13077 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAF1Q13077 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAF1Q13077 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAF1Q13077 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAF1Q13077 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAF1Q13077 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAF1Q13077 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAF1Q13077 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAF1Q13077 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAF1Q13077 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAF1Q13077 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAF1Q13077 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAF1Q13077 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAF1Q13077 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAF1Q13077 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAF1Q13077 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAF1Q13077 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAF1Q13077 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAF1Q13077 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAF1Q13077 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAF1Q13077 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAF1Q13077 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAF1Q13077 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAF1Q13077 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAF1Q13077 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAF1Q13077 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAF1Q13077 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAF1Q13077 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAF1Q13077 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAF1Q13077 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAF1Q13077 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAF1Q13077 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAF1Q13077 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAF1Q13077 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAF1Q13077 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAF1Q13077 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAF1Q13077 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAF1Q13077 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAF1Q13077 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAF1Q13077 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAF1Q13077 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAF1Q13077 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAF1Q13077 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAF1Q13077 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAF1Q13077 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAF1Q13077 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAF1Q13077 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAF1Q13077 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAF1Q13077 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAF1Q13077 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAF1Q13077 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAF1Q13077 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAF1Q13077 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAF1Q13077 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAF1Q13077 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAF1Q13077 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAF1Q13077 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAF1Q13077 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAF1Q13077 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAF1Q13077 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAF1Q13077 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAF1Q13077 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAF1Q13077 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAF1Q13077 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAF1Q13077 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAF1Q13077 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAF1Q13077 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAF1Q13077 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAF1Q13077 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAF1Q13077 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAF1Q13077 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRAF1Q13077 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRAF1Q13077 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAF1Q13077 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAF1Q13077 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAF1Q13077 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAF1Q13077 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAF1Q13077 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAF1Q13077 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAF1Q13077 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAF1Q13077 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAF1Q13077 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAF1Q13077 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAF1Q13077 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAF1Q13077 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAF1Q13077 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAF1Q13077 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAF1Q13077 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAF1Q13077 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAF1Q13077 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAF1Q13077 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAF1Q13077 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAF1Q13077 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAF1Q13077 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAF1Q13077 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAF1Q13077 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
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