Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXC1Q12948 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXC1Q12948 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXC1Q12948 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXC1Q12948 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXC1Q12948 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXC1Q12948 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXC1Q12948 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXC1Q12948 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXC1Q12948 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXC1Q12948 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXC1Q12948 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXC1Q12948 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXC1Q12948 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXC1Q12948 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXC1Q12948 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXC1Q12948 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXC1Q12948 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXC1Q12948 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXC1Q12948 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXC1Q12948 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXC1Q12948 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXC1Q12948 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FOXC1Q12948 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FOXC1Q12948 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXC1Q12948 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXC1Q12948 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXC1Q12948 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXC1Q12948 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXC1Q12948 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXC1Q12948 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXC1Q12948 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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FOXC1Q12948 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FOXC1Q12948 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FOXC1Q12948 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FOXC1Q12948 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXC1Q12948 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXC1Q12948 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXC1Q12948 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXC1Q12948 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
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FOXC1Q12948 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXC1Q12948 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXC1Q12948 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXC1Q12948 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXC1Q12948 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXC1Q12948 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXC1Q12948 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXC1Q12948 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXC1Q12948 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXC1Q12948 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXC1Q12948 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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