Protein–RNA interactions for Protein: Q12766

HMGXB3, HMG domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB3Q12766 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.61
HMGXB3Q12766 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
HMGXB3Q12766 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC37.62■■■■□ 3.61
HMGXB3Q12766 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
HMGXB3Q12766 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.62■■■■□ 3.61
HMGXB3Q12766 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
HMGXB3Q12766 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
HMGXB3Q12766 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
HMGXB3Q12766 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
HMGXB3Q12766 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
HMGXB3Q12766 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
HMGXB3Q12766 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
HMGXB3Q12766 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
HMGXB3Q12766 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
HMGXB3Q12766 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
HMGXB3Q12766 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
HMGXB3Q12766 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
HMGXB3Q12766 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
HMGXB3Q12766 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
HMGXB3Q12766 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
HMGXB3Q12766 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
HMGXB3Q12766 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
HMGXB3Q12766 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
HMGXB3Q12766 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
HMGXB3Q12766 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
HMGXB3Q12766 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
HMGXB3Q12766 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
HMGXB3Q12766 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC37.6■■■■□ 3.61
HMGXB3Q12766 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC37.6■■■■□ 3.61
HMGXB3Q12766 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC37.6■■■■□ 3.61
HMGXB3Q12766 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
HMGXB3Q12766 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC37.6■■■■□ 3.61
HMGXB3Q12766 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
HMGXB3Q12766 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC37.6■■■■□ 3.61
HMGXB3Q12766 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
HMGXB3Q12766 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
HMGXB3Q12766 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
HMGXB3Q12766 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
HMGXB3Q12766 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
HMGXB3Q12766 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
HMGXB3Q12766 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
HMGXB3Q12766 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
HMGXB3Q12766 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
HMGXB3Q12766 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
HMGXB3Q12766 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
HMGXB3Q12766 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
HMGXB3Q12766 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
HMGXB3Q12766 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
HMGXB3Q12766 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
HMGXB3Q12766 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC37.58■■■■□ 3.61
HMGXB3Q12766 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
HMGXB3Q12766 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
HMGXB3Q12766 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
HMGXB3Q12766 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
HMGXB3Q12766 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
HMGXB3Q12766 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
HMGXB3Q12766 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
HMGXB3Q12766 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
HMGXB3Q12766 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
HMGXB3Q12766 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.57■■■■□ 3.61
HMGXB3Q12766 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC37.57■■■■□ 3.61
HMGXB3Q12766 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.61
HMGXB3Q12766 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
HMGXB3Q12766 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.6
HMGXB3Q12766 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
HMGXB3Q12766 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
HMGXB3Q12766 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC37.56■■■■□ 3.6
HMGXB3Q12766 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
HMGXB3Q12766 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
HMGXB3Q12766 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
HMGXB3Q12766 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
HMGXB3Q12766 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
HMGXB3Q12766 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
HMGXB3Q12766 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
HMGXB3Q12766 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
HMGXB3Q12766 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
HMGXB3Q12766 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
HMGXB3Q12766 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
HMGXB3Q12766 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
HMGXB3Q12766 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
HMGXB3Q12766 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
HMGXB3Q12766 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
HMGXB3Q12766 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
HMGXB3Q12766 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
HMGXB3Q12766 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
HMGXB3Q12766 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC37.53■■■■□ 3.6
HMGXB3Q12766 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
HMGXB3Q12766 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
HMGXB3Q12766 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC37.53■■■■□ 3.6
HMGXB3Q12766 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
HMGXB3Q12766 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
HMGXB3Q12766 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
HMGXB3Q12766 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
HMGXB3Q12766 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
HMGXB3Q12766 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
HMGXB3Q12766 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
HMGXB3Q12766 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC37.52■■■■□ 3.6
HMGXB3Q12766 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
HMGXB3Q12766 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
HMGXB3Q12766 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
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