Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NIPAL4Q0D2K0 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NIPAL4Q0D2K0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NIPAL4Q0D2K0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NIPAL4Q0D2K0 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NIPAL4Q0D2K0 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NIPAL4Q0D2K0 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NIPAL4Q0D2K0 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NIPAL4Q0D2K0 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NIPAL4Q0D2K0 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NIPAL4Q0D2K0 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NIPAL4Q0D2K0 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NIPAL4Q0D2K0 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NIPAL4Q0D2K0 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NIPAL4Q0D2K0 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NIPAL4Q0D2K0 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NIPAL4Q0D2K0 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NIPAL4Q0D2K0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NIPAL4Q0D2K0 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NIPAL4Q0D2K0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NIPAL4Q0D2K0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NIPAL4Q0D2K0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NIPAL4Q0D2K0 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NIPAL4Q0D2K0 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NIPAL4Q0D2K0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NIPAL4Q0D2K0 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NIPAL4Q0D2K0 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NIPAL4Q0D2K0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NIPAL4Q0D2K0 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NIPAL4Q0D2K0 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NIPAL4Q0D2K0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NIPAL4Q0D2K0 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NIPAL4Q0D2K0 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NIPAL4Q0D2K0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NIPAL4Q0D2K0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NIPAL4Q0D2K0 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NIPAL4Q0D2K0 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NIPAL4Q0D2K0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NIPAL4Q0D2K0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NIPAL4Q0D2K0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NIPAL4Q0D2K0 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NIPAL4Q0D2K0 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NIPAL4Q0D2K0 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NIPAL4Q0D2K0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NIPAL4Q0D2K0 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NIPAL4Q0D2K0 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NIPAL4Q0D2K0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NIPAL4Q0D2K0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NIPAL4Q0D2K0 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NIPAL4Q0D2K0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NIPAL4Q0D2K0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NIPAL4Q0D2K0 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NIPAL4Q0D2K0 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NIPAL4Q0D2K0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NIPAL4Q0D2K0 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NIPAL4Q0D2K0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NIPAL4Q0D2K0 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NIPAL4Q0D2K0 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NIPAL4Q0D2K0 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NIPAL4Q0D2K0 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NIPAL4Q0D2K0 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NIPAL4Q0D2K0 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NIPAL4Q0D2K0 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NIPAL4Q0D2K0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NIPAL4Q0D2K0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NIPAL4Q0D2K0 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NIPAL4Q0D2K0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NIPAL4Q0D2K0 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NIPAL4Q0D2K0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NIPAL4Q0D2K0 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NIPAL4Q0D2K0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NIPAL4Q0D2K0 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NIPAL4Q0D2K0 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NIPAL4Q0D2K0 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NIPAL4Q0D2K0 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NIPAL4Q0D2K0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NIPAL4Q0D2K0 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NIPAL4Q0D2K0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NIPAL4Q0D2K0 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NIPAL4Q0D2K0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NIPAL4Q0D2K0 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NIPAL4Q0D2K0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NIPAL4Q0D2K0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NIPAL4Q0D2K0 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NIPAL4Q0D2K0 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NIPAL4Q0D2K0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NIPAL4Q0D2K0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NIPAL4Q0D2K0 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NIPAL4Q0D2K0 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NIPAL4Q0D2K0 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NIPAL4Q0D2K0 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NIPAL4Q0D2K0 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NIPAL4Q0D2K0 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NIPAL4Q0D2K0 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NIPAL4Q0D2K0 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NIPAL4Q0D2K0 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NIPAL4Q0D2K0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NIPAL4Q0D2K0 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NIPAL4Q0D2K0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NIPAL4Q0D2K0 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms