Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNA1Q09470 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNA1Q09470 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNA1Q09470 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNA1Q09470 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNA1Q09470 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNA1Q09470 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNA1Q09470 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNA1Q09470 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNA1Q09470 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNA1Q09470 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNA1Q09470 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNA1Q09470 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KCNA1Q09470 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KCNA1Q09470 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNA1Q09470 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNA1Q09470 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNA1Q09470 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNA1Q09470 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNA1Q09470 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNA1Q09470 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNA1Q09470 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNA1Q09470 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNA1Q09470 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNA1Q09470 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNA1Q09470 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNA1Q09470 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNA1Q09470 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNA1Q09470 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNA1Q09470 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNA1Q09470 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNA1Q09470 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNA1Q09470 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNA1Q09470 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNA1Q09470 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNA1Q09470 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNA1Q09470 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNA1Q09470 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNA1Q09470 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNA1Q09470 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNA1Q09470 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNA1Q09470 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNA1Q09470 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNA1Q09470 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNA1Q09470 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNA1Q09470 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNA1Q09470 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNA1Q09470 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNA1Q09470 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNA1Q09470 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNA1Q09470 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNA1Q09470 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNA1Q09470 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNA1Q09470 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNA1Q09470 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNA1Q09470 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNA1Q09470 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNA1Q09470 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNA1Q09470 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNA1Q09470 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNA1Q09470 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNA1Q09470 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNA1Q09470 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNA1Q09470 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNA1Q09470 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNA1Q09470 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNA1Q09470 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNA1Q09470 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNA1Q09470 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNA1Q09470 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNA1Q09470 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNA1Q09470 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNA1Q09470 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNA1Q09470 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNA1Q09470 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNA1Q09470 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNA1Q09470 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNA1Q09470 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNA1Q09470 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNA1Q09470 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNA1Q09470 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNA1Q09470 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNA1Q09470 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNA1Q09470 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNA1Q09470 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNA1Q09470 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNA1Q09470 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNA1Q09470 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNA1Q09470 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNA1Q09470 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNA1Q09470 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNA1Q09470 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNA1Q09470 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNA1Q09470 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNA1Q09470 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNA1Q09470 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNA1Q09470 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNA1Q09470 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNA1Q09470 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNA1Q09470 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms