Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SSRP1Q08945 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SSRP1Q08945 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SSRP1Q08945 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SSRP1Q08945 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SSRP1Q08945 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SSRP1Q08945 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SSRP1Q08945 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SSRP1Q08945 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SSRP1Q08945 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SSRP1Q08945 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SSRP1Q08945 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SSRP1Q08945 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SSRP1Q08945 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SSRP1Q08945 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SSRP1Q08945 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SSRP1Q08945 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SSRP1Q08945 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SSRP1Q08945 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SSRP1Q08945 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SSRP1Q08945 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SSRP1Q08945 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SSRP1Q08945 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SSRP1Q08945 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SSRP1Q08945 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SSRP1Q08945 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SSRP1Q08945 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SSRP1Q08945 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SSRP1Q08945 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SSRP1Q08945 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SSRP1Q08945 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SSRP1Q08945 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SSRP1Q08945 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SSRP1Q08945 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SSRP1Q08945 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SSRP1Q08945 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SSRP1Q08945 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SSRP1Q08945 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SSRP1Q08945 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SSRP1Q08945 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SSRP1Q08945 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SSRP1Q08945 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SSRP1Q08945 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SSRP1Q08945 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SSRP1Q08945 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SSRP1Q08945 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SSRP1Q08945 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SSRP1Q08945 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SSRP1Q08945 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SSRP1Q08945 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SSRP1Q08945 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SSRP1Q08945 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SSRP1Q08945 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SSRP1Q08945 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SSRP1Q08945 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SSRP1Q08945 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SSRP1Q08945 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SSRP1Q08945 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SSRP1Q08945 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SSRP1Q08945 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SSRP1Q08945 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SSRP1Q08945 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SSRP1Q08945 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SSRP1Q08945 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SSRP1Q08945 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SSRP1Q08945 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SSRP1Q08945 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SSRP1Q08945 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SSRP1Q08945 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SSRP1Q08945 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SSRP1Q08945 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SSRP1Q08945 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SSRP1Q08945 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SSRP1Q08945 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SSRP1Q08945 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SSRP1Q08945 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SSRP1Q08945 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSRP1Q08945 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSRP1Q08945 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSRP1Q08945 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSRP1Q08945 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSRP1Q08945 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSRP1Q08945 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSRP1Q08945 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSRP1Q08945 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSRP1Q08945 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSRP1Q08945 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSRP1Q08945 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSRP1Q08945 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSRP1Q08945 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SSRP1Q08945 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SSRP1Q08945 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSRP1Q08945 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SSRP1Q08945 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SSRP1Q08945 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SSRP1Q08945 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SSRP1Q08945 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SSRP1Q08945 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SSRP1Q08945 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SSRP1Q08945 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms