Protein–RNA interactions for Protein: Q08109

HRD1, ERAD-associated E3 ubiquitin-protein ligase HRD1, yeastyeast

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HRD1Q08109 DNA2YHR164C 4569 nt2.08□□□□□ -2.08
HRD1Q08109 YDR186CYDR186C 2634 nt2.08□□□□□ -2.08
HRD1Q08109 GCV2YMR189W 3105 nt2.08□□□□□ -2.08
HRD1Q08109 PCL9YDL179W 915 nt2.08□□□□□ -2.08
HRD1Q08109 YGR073CYGR073C 372 nt2.08□□□□□ -2.08
HRD1Q08109 DOG1YHR044C 741 nt2.08□□□□□ -2.08
HRD1Q08109 YAL026C-AYAL026C-A 438 nt2.08□□□□□ -2.08
HRD1Q08109 YLR347W-AYLR347W-A 141 nt2.08□□□□□ -2.08
HRD1Q08109 MSN1YOL116W 1149 nt2.08□□□□□ -2.08
HRD1Q08109 YOR050CYOR050C 348 nt2.08□□□□□ -2.08
HRD1Q08109 YOR055WYOR055W 435 nt2.08□□□□□ -2.08
HRD1Q08109 CAT5YOR125C 702 nt2.08□□□□□ -2.08
HRD1Q08109 BTS1YPL069C 1008 nt2.08□□□□□ -2.08
HRD1Q08109 MSS4YDR208W 2340 nt2.08□□□□□ -2.08
HRD1Q08109 MAK5YBR142W 2322 nt2.08□□□□□ -2.08
HRD1Q08109 TRM12YML005W 1389 nt2.08□□□□□ -2.08
HRD1Q08109 ENP2YGR145W 2124 nt2.08□□□□□ -2.08
HRD1Q08109 RSE1YML049C 4086 nt2.07□□□□□ -2.08
HRD1Q08109 MPS1YDL028C 2295 nt2.07□□□□□ -2.08
HRD1Q08109 YGR111WYGR111W 1203 nt2.07□□□□□ -2.08
HRD1Q08109 COG2YGR120C 789 nt2.07□□□□□ -2.08
HRD1Q08109 YGR219WYGR219W 342 nt2.07□□□□□ -2.08
HRD1Q08109 MBB1YJL199C 327 nt2.07□□□□□ -2.08
HRD1Q08109 GPI14YJR013W 1212 nt2.07□□□□□ -2.08
HRD1Q08109 BET3YKR068C 582 nt2.07□□□□□ -2.08
HRD1Q08109 YLR225CYLR225C 1224 nt2.07□□□□□ -2.08
HRD1Q08109 MRPS17YMR188C 714 nt2.07□□□□□ -2.08
HRD1Q08109 ATG34YOL083W 1239 nt2.07□□□□□ -2.08
HRD1Q08109 YOR331CYOR331C 558 nt2.07□□□□□ -2.08
HRD1Q08109 YOR365CYOR365C 2112 nt2.07□□□□□ -2.08
HRD1Q08109 SUR1YPL057C 1149 nt2.07□□□□□ -2.08
HRD1Q08109 HER2YMR293C 1395 nt2.07□□□□□ -2.08
HRD1Q08109 MPC54YOR177C 1395 nt2.07□□□□□ -2.08
HRD1Q08109 MON1YGL124C 1935 nt2.07□□□□□ -2.08
HRD1Q08109 BOI1YBL085W 2943 nt2.07□□□□□ -2.08
HRD1Q08109 SVL3YPL032C 2478 nt2.07□□□□□ -2.08
HRD1Q08109 HBT1YDL223C 3141 nt2.06□□□□□ -2.08
HRD1Q08109 YFH1YDL120W 525 nt2.06□□□□□ -2.08
HRD1Q08109 MCM21YDR318W 1107 nt2.06□□□□□ -2.08
HRD1Q08109 YEL075CYEL075C 369 nt2.06□□□□□ -2.08
HRD1Q08109 PMI40YER003C 1290 nt2.06□□□□□ -2.08
HRD1Q08109 RTT105YER104W 627 nt2.06□□□□□ -2.08
HRD1Q08109 LSM8YJR022W 330 nt2.06□□□□□ -2.08
HRD1Q08109 PET191YJR034W 327 nt2.06□□□□□ -2.08
HRD1Q08109 REX3YLR107W 1215 nt2.06□□□□□ -2.08
HRD1Q08109 PML39YML107C 1005 nt2.06□□□□□ -2.08
HRD1Q08109 RPB8YOR224C 441 nt2.06□□□□□ -2.08
HRD1Q08109 APD1YBR151W 951 nt2.06□□□□□ -2.08
HRD1Q08109 YMR1YJR110W 2067 nt2.06□□□□□ -2.08
HRD1Q08109 PDR11YIL013C 4236 nt2.06□□□□□ -2.08
HRD1Q08109 CTF18YMR078C 2226 nt2.06□□□□□ -2.08
HRD1Q08109 HMO1YDR174W 741 nt2.05□□□□□ -2.08
HRD1Q08109 YHR069C-AYHR069C-A 363 nt2.05□□□□□ -2.08
HRD1Q08109 YAL031W-AYAL031W-A 309 nt2.05□□□□□ -2.08
HRD1Q08109 YLR154W-EYLR154W-E 204 nt2.05□□□□□ -2.08
HRD1Q08109 TRM112YNR046W 408 nt2.05□□□□□ -2.08
HRD1Q08109 YOL166CYOL166C 339 nt2.05□□□□□ -2.08
HRD1Q08109 YPL035CYPL035C 348 nt2.05□□□□□ -2.08
HRD1Q08109 MSH4YFL003C 2637 nt2.05□□□□□ -2.08
HRD1Q08109 YML096WYML096W 1578 nt2.05□□□□□ -2.08
HRD1Q08109 SNX41YDR425W 1878 nt2.05□□□□□ -2.08
HRD1Q08109 CWH41YGL027C 2502 nt2.05□□□□□ -2.08
HRD1Q08109 SCD5YOR329C 2619 nt2.04□□□□□ -2.08
HRD1Q08109 YOL098CYOL098C 3114 nt2.04□□□□□ -2.08
HRD1Q08109 LRS4YDR439W 1044 nt2.04□□□□□ -2.08
HRD1Q08109 AMS1YGL156W 3252 nt2.04□□□□□ -2.08
HRD1Q08109 PEX4YGR133W 552 nt2.04□□□□□ -2.08
HRD1Q08109 USB1YLR132C 873 nt2.04□□□□□ -2.08
HRD1Q08109 YBL028CYBL028C 321 nt2.04□□□□□ -2.08
HRD1Q08109 YOL057WYOL057W 2136 nt2.04□□□□□ -2.08
HRD1Q08109 YOR097CYOR097C 528 nt2.04□□□□□ -2.08
HRD1Q08109 YRR1YOR162C 2433 nt2.04□□□□□ -2.08
HRD1Q08109 SPB1YCL054W 2526 nt2.04□□□□□ -2.08
HRD1Q08109 ATP22YDR350C 2055 nt2.03□□□□□ -2.08
HRD1Q08109 YGL159WYGL159W 1113 nt2.03□□□□□ -2.08
HRD1Q08109 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt2.03□□□□□ -2.08
HRD1Q08109 EPT1YHR123W 1176 nt2.03□□□□□ -2.08
HRD1Q08109 PEX18YHR160C 852 nt2.03□□□□□ -2.08
HRD1Q08109 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.03□□□□□ -2.08
HRD1Q08109 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.03□□□□□ -2.08
HRD1Q08109 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.03□□□□□ -2.08
HRD1Q08109 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.03□□□□□ -2.08
HRD1Q08109 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.03□□□□□ -2.08
HRD1Q08109 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.03□□□□□ -2.08
HRD1Q08109 CWC24YLR323C 780 nt2.03□□□□□ -2.08
HRD1Q08109 SAS2YMR127C 1017 nt2.03□□□□□ -2.08
HRD1Q08109 YPL071CYPL071C 471 nt2.03□□□□□ -2.08
HRD1Q08109 YBR209WYBR209W 318 nt2.03□□□□□ -2.08
HRD1Q08109 RGA1YOR127W 3024 nt2.03□□□□□ -2.08
HRD1Q08109 DNL4YOR005C 2835 nt2.02□□□□□ -2.09
HRD1Q08109 UBX3YDL091C 1368 nt2.02□□□□□ -2.09
HRD1Q08109 LSM6YDR378C 261 nt2.02□□□□□ -2.09
HRD1Q08109 TIM9YEL020W-A 264 nt2.02□□□□□ -2.09
HRD1Q08109 SMX2YFL017W-A 234 nt2.02□□□□□ -2.09
HRD1Q08109 MRPL9YGR220C 810 nt2.02□□□□□ -2.09
HRD1Q08109 CDC123YLR215C 1083 nt2.02□□□□□ -2.09
HRD1Q08109 COQ10YOL008W 624 nt2.02□□□□□ -2.09
HRD1Q08109 YPL276WYPL276W 438 nt2.02□□□□□ -2.09
HRD1Q08109 RRG8YPR116W 834 nt2.02□□□□□ -2.09
HRD1Q08109 ELG1YOR144C 2376 nt2.02□□□□□ -2.09
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