Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SOX4Q06945 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SOX4Q06945 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SOX4Q06945 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SOX4Q06945 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SOX4Q06945 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SOX4Q06945 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SOX4Q06945 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SOX4Q06945 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SOX4Q06945 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SOX4Q06945 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SOX4Q06945 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SOX4Q06945 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SOX4Q06945 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SOX4Q06945 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SOX4Q06945 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SOX4Q06945 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SOX4Q06945 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SOX4Q06945 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SOX4Q06945 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SOX4Q06945 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SOX4Q06945 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SOX4Q06945 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SOX4Q06945 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SOX4Q06945 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SOX4Q06945 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SOX4Q06945 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SOX4Q06945 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SOX4Q06945 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SOX4Q06945 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SOX4Q06945 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SOX4Q06945 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SOX4Q06945 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SOX4Q06945 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SOX4Q06945 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SOX4Q06945 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SOX4Q06945 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SOX4Q06945 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SOX4Q06945 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SOX4Q06945 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SOX4Q06945 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SOX4Q06945 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SOX4Q06945 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SOX4Q06945 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SOX4Q06945 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SOX4Q06945 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SOX4Q06945 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SOX4Q06945 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SOX4Q06945 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SOX4Q06945 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SOX4Q06945 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SOX4Q06945 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SOX4Q06945 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SOX4Q06945 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SOX4Q06945 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SOX4Q06945 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SOX4Q06945 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SOX4Q06945 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SOX4Q06945 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SOX4Q06945 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SOX4Q06945 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SOX4Q06945 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SOX4Q06945 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SOX4Q06945 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SOX4Q06945 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SOX4Q06945 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SOX4Q06945 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SOX4Q06945 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SOX4Q06945 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SOX4Q06945 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SOX4Q06945 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SOX4Q06945 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SOX4Q06945 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SOX4Q06945 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SOX4Q06945 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SOX4Q06945 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SOX4Q06945 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SOX4Q06945 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SOX4Q06945 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SOX4Q06945 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SOX4Q06945 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SOX4Q06945 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SOX4Q06945 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SOX4Q06945 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SOX4Q06945 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SOX4Q06945 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SOX4Q06945 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SOX4Q06945 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SOX4Q06945 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SOX4Q06945 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SOX4Q06945 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SOX4Q06945 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SOX4Q06945 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SOX4Q06945 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SOX4Q06945 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SOX4Q06945 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SOX4Q06945 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SOX4Q06945 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SOX4Q06945 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SOX4Q06945 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms