Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PAX8Q06710 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms