Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNG1Q06432 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNG1Q06432 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNG1Q06432 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNG1Q06432 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNG1Q06432 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNG1Q06432 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNG1Q06432 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNG1Q06432 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNG1Q06432 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNG1Q06432 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNG1Q06432 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNG1Q06432 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNG1Q06432 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNG1Q06432 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNG1Q06432 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNG1Q06432 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CACNG1Q06432 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
CACNG1Q06432 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
CACNG1Q06432 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CACNG1Q06432 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CACNG1Q06432 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CACNG1Q06432 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CACNG1Q06432 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CACNG1Q06432 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CACNG1Q06432 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CACNG1Q06432 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CACNG1Q06432 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CACNG1Q06432 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNG1Q06432 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNG1Q06432 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNG1Q06432 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNG1Q06432 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNG1Q06432 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNG1Q06432 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNG1Q06432 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNG1Q06432 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNG1Q06432 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNG1Q06432 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNG1Q06432 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNG1Q06432 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNG1Q06432 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNG1Q06432 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNG1Q06432 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNG1Q06432 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNG1Q06432 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNG1Q06432 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNG1Q06432 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNG1Q06432 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNG1Q06432 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNG1Q06432 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CACNG1Q06432 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CACNG1Q06432 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CACNG1Q06432 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CACNG1Q06432 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CACNG1Q06432 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CACNG1Q06432 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CACNG1Q06432 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CACNG1Q06432 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CACNG1Q06432 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CACNG1Q06432 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CACNG1Q06432 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CACNG1Q06432 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CACNG1Q06432 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CACNG1Q06432 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CACNG1Q06432 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CACNG1Q06432 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CACNG1Q06432 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CACNG1Q06432 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CACNG1Q06432 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CACNG1Q06432 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CACNG1Q06432 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CACNG1Q06432 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CACNG1Q06432 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CACNG1Q06432 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CACNG1Q06432 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CACNG1Q06432 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CACNG1Q06432 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CACNG1Q06432 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CACNG1Q06432 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CACNG1Q06432 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CACNG1Q06432 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CACNG1Q06432 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CACNG1Q06432 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CACNG1Q06432 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CACNG1Q06432 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CACNG1Q06432 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CACNG1Q06432 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CACNG1Q06432 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNG1Q06432 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNG1Q06432 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNG1Q06432 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNG1Q06432 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNG1Q06432 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNG1Q06432 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNG1Q06432 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNG1Q06432 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNG1Q06432 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNG1Q06432 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNG1Q06432 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms