Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
EXOSC9Q06265 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
EXOSC9Q06265 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
EXOSC9Q06265 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
EXOSC9Q06265 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
EXOSC9Q06265 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
EXOSC9Q06265 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
EXOSC9Q06265 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
EXOSC9Q06265 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
EXOSC9Q06265 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
EXOSC9Q06265 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
EXOSC9Q06265 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
EXOSC9Q06265 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
EXOSC9Q06265 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
EXOSC9Q06265 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
EXOSC9Q06265 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
EXOSC9Q06265 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
EXOSC9Q06265 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
EXOSC9Q06265 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
EXOSC9Q06265 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
EXOSC9Q06265 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
EXOSC9Q06265 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
EXOSC9Q06265 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
EXOSC9Q06265 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
EXOSC9Q06265 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
EXOSC9Q06265 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EXOSC9Q06265 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EXOSC9Q06265 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
EXOSC9Q06265 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
EXOSC9Q06265 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EXOSC9Q06265 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EXOSC9Q06265 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
EXOSC9Q06265 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
EXOSC9Q06265 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EXOSC9Q06265 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EXOSC9Q06265 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EXOSC9Q06265 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
EXOSC9Q06265 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
EXOSC9Q06265 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
EXOSC9Q06265 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EXOSC9Q06265 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
EXOSC9Q06265 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
EXOSC9Q06265 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EXOSC9Q06265 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
EXOSC9Q06265 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EXOSC9Q06265 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
EXOSC9Q06265 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
EXOSC9Q06265 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EXOSC9Q06265 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EXOSC9Q06265 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EXOSC9Q06265 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EXOSC9Q06265 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EXOSC9Q06265 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
EXOSC9Q06265 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EXOSC9Q06265 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EXOSC9Q06265 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EXOSC9Q06265 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
EXOSC9Q06265 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EXOSC9Q06265 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
EXOSC9Q06265 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
EXOSC9Q06265 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
EXOSC9Q06265 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
EXOSC9Q06265 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EXOSC9Q06265 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EXOSC9Q06265 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EXOSC9Q06265 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
EXOSC9Q06265 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
EXOSC9Q06265 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
EXOSC9Q06265 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EXOSC9Q06265 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
EXOSC9Q06265 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
EXOSC9Q06265 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
EXOSC9Q06265 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
EXOSC9Q06265 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
EXOSC9Q06265 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
EXOSC9Q06265 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
EXOSC9Q06265 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
EXOSC9Q06265 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
EXOSC9Q06265 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
EXOSC9Q06265 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
EXOSC9Q06265 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
EXOSC9Q06265 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
EXOSC9Q06265 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
EXOSC9Q06265 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
EXOSC9Q06265 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
EXOSC9Q06265 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
EXOSC9Q06265 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
EXOSC9Q06265 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
EXOSC9Q06265 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
EXOSC9Q06265 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
EXOSC9Q06265 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
EXOSC9Q06265 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
EXOSC9Q06265 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
EXOSC9Q06265 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
EXOSC9Q06265 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
EXOSC9Q06265 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
EXOSC9Q06265 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
EXOSC9Q06265 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
EXOSC9Q06265 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
EXOSC9Q06265 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms