Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE3AQ05086 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE3AQ05086 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE3AQ05086 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE3AQ05086 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE3AQ05086 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE3AQ05086 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE3AQ05086 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE3AQ05086 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE3AQ05086 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE3AQ05086 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE3AQ05086 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE3AQ05086 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE3AQ05086 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE3AQ05086 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE3AQ05086 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE3AQ05086 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE3AQ05086 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE3AQ05086 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE3AQ05086 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE3AQ05086 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE3AQ05086 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE3AQ05086 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE3AQ05086 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE3AQ05086 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE3AQ05086 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE3AQ05086 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE3AQ05086 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE3AQ05086 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE3AQ05086 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE3AQ05086 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE3AQ05086 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE3AQ05086 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE3AQ05086 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE3AQ05086 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE3AQ05086 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE3AQ05086 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE3AQ05086 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE3AQ05086 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE3AQ05086 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE3AQ05086 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE3AQ05086 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE3AQ05086 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE3AQ05086 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE3AQ05086 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE3AQ05086 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE3AQ05086 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE3AQ05086 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE3AQ05086 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE3AQ05086 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE3AQ05086 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBE3AQ05086 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBE3AQ05086 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE3AQ05086 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE3AQ05086 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE3AQ05086 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE3AQ05086 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE3AQ05086 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE3AQ05086 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE3AQ05086 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE3AQ05086 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE3AQ05086 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE3AQ05086 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE3AQ05086 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE3AQ05086 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE3AQ05086 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE3AQ05086 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE3AQ05086 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE3AQ05086 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE3AQ05086 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE3AQ05086 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE3AQ05086 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE3AQ05086 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE3AQ05086 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE3AQ05086 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE3AQ05086 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE3AQ05086 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE3AQ05086 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE3AQ05086 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE3AQ05086 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE3AQ05086 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE3AQ05086 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE3AQ05086 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE3AQ05086 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE3AQ05086 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE3AQ05086 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE3AQ05086 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE3AQ05086 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE3AQ05086 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE3AQ05086 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE3AQ05086 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE3AQ05086 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE3AQ05086 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE3AQ05086 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE3AQ05086 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE3AQ05086 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE3AQ05086 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE3AQ05086 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE3AQ05086 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE3AQ05086 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms