Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EMX2Q04743 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EMX2Q04743 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EMX2Q04743 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EMX2Q04743 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EMX2Q04743 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EMX2Q04743 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
EMX2Q04743 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EMX2Q04743 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EMX2Q04743 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EMX2Q04743 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EMX2Q04743 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EMX2Q04743 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EMX2Q04743 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EMX2Q04743 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EMX2Q04743 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
EMX2Q04743 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EMX2Q04743 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
EMX2Q04743 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EMX2Q04743 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EMX2Q04743 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EMX2Q04743 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EMX2Q04743 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EMX2Q04743 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EMX2Q04743 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
EMX2Q04743 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
EMX2Q04743 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
EMX2Q04743 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EMX2Q04743 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EMX2Q04743 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EMX2Q04743 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
EMX2Q04743 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EMX2Q04743 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EMX2Q04743 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EMX2Q04743 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EMX2Q04743 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMX2Q04743 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMX2Q04743 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMX2Q04743 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMX2Q04743 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMX2Q04743 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMX2Q04743 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMX2Q04743 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMX2Q04743 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
EMX2Q04743 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
EMX2Q04743 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMX2Q04743 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMX2Q04743 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMX2Q04743 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMX2Q04743 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
EMX2Q04743 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMX2Q04743 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMX2Q04743 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMX2Q04743 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMX2Q04743 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMX2Q04743 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMX2Q04743 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMX2Q04743 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMX2Q04743 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMX2Q04743 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMX2Q04743 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMX2Q04743 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
EMX2Q04743 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMX2Q04743 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMX2Q04743 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMX2Q04743 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMX2Q04743 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMX2Q04743 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMX2Q04743 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMX2Q04743 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
EMX2Q04743 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMX2Q04743 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMX2Q04743 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMX2Q04743 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMX2Q04743 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMX2Q04743 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMX2Q04743 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EMX2Q04743 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EMX2Q04743 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EMX2Q04743 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EMX2Q04743 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EMX2Q04743 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EMX2Q04743 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EMX2Q04743 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EMX2Q04743 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EMX2Q04743 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EMX2Q04743 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EMX2Q04743 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EMX2Q04743 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EMX2Q04743 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EMX2Q04743 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EMX2Q04743 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EMX2Q04743 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EMX2Q04743 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EMX2Q04743 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EMX2Q04743 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EMX2Q04743 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EMX2Q04743 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EMX2Q04743 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EMX2Q04743 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms