Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PLOD1Q02809 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PLOD1Q02809 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLOD1Q02809 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLOD1Q02809 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLOD1Q02809 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLOD1Q02809 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLOD1Q02809 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLOD1Q02809 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLOD1Q02809 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLOD1Q02809 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLOD1Q02809 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLOD1Q02809 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLOD1Q02809 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLOD1Q02809 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLOD1Q02809 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLOD1Q02809 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLOD1Q02809 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLOD1Q02809 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PLOD1Q02809 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLOD1Q02809 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PLOD1Q02809 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PLOD1Q02809 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PLOD1Q02809 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PLOD1Q02809 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PLOD1Q02809 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PLOD1Q02809 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PLOD1Q02809 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PLOD1Q02809 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PLOD1Q02809 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PLOD1Q02809 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PLOD1Q02809 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PLOD1Q02809 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PLOD1Q02809 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PLOD1Q02809 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PLOD1Q02809 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PLOD1Q02809 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PLOD1Q02809 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PLOD1Q02809 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PLOD1Q02809 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PLOD1Q02809 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PLOD1Q02809 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PLOD1Q02809 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PLOD1Q02809 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PLOD1Q02809 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PLOD1Q02809 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PLOD1Q02809 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PLOD1Q02809 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PLOD1Q02809 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PLOD1Q02809 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PLOD1Q02809 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PLOD1Q02809 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PLOD1Q02809 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PLOD1Q02809 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PLOD1Q02809 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PLOD1Q02809 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PLOD1Q02809 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PLOD1Q02809 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PLOD1Q02809 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PLOD1Q02809 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PLOD1Q02809 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PLOD1Q02809 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PLOD1Q02809 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PLOD1Q02809 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PLOD1Q02809 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PLOD1Q02809 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PLOD1Q02809 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PLOD1Q02809 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PLOD1Q02809 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PLOD1Q02809 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PLOD1Q02809 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PLOD1Q02809 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PLOD1Q02809 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PLOD1Q02809 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PLOD1Q02809 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PLOD1Q02809 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PLOD1Q02809 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PLOD1Q02809 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PLOD1Q02809 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PLOD1Q02809 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PLOD1Q02809 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PLOD1Q02809 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PLOD1Q02809 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PLOD1Q02809 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PLOD1Q02809 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PLOD1Q02809 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PLOD1Q02809 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PLOD1Q02809 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PLOD1Q02809 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PLOD1Q02809 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PLOD1Q02809 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PLOD1Q02809 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PLOD1Q02809 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PLOD1Q02809 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PLOD1Q02809 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PLOD1Q02809 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PLOD1Q02809 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PLOD1Q02809 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PLOD1Q02809 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PLOD1Q02809 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms