Protein–RNA interactions for Protein: Q02446

SP4, Transcription factor Sp4, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP4Q02446 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SP4Q02446 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SP4Q02446 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SP4Q02446 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SP4Q02446 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SP4Q02446 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SP4Q02446 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SP4Q02446 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SP4Q02446 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SP4Q02446 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SP4Q02446 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SP4Q02446 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SP4Q02446 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SP4Q02446 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SP4Q02446 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SP4Q02446 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SP4Q02446 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SP4Q02446 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SP4Q02446 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SP4Q02446 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SP4Q02446 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SP4Q02446 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SP4Q02446 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SP4Q02446 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SP4Q02446 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SP4Q02446 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SP4Q02446 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SP4Q02446 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SP4Q02446 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SP4Q02446 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SP4Q02446 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SP4Q02446 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SP4Q02446 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SP4Q02446 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SP4Q02446 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SP4Q02446 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SP4Q02446 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SP4Q02446 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SP4Q02446 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SP4Q02446 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SP4Q02446 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SP4Q02446 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SP4Q02446 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SP4Q02446 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SP4Q02446 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SP4Q02446 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SP4Q02446 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SP4Q02446 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SP4Q02446 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SP4Q02446 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SP4Q02446 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SP4Q02446 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SP4Q02446 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SP4Q02446 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SP4Q02446 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SP4Q02446 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SP4Q02446 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SP4Q02446 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SP4Q02446 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SP4Q02446 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SP4Q02446 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SP4Q02446 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SP4Q02446 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SP4Q02446 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SP4Q02446 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SP4Q02446 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SP4Q02446 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SP4Q02446 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SP4Q02446 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SP4Q02446 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SP4Q02446 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SP4Q02446 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SP4Q02446 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SP4Q02446 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SP4Q02446 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SP4Q02446 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SP4Q02446 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SP4Q02446 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SP4Q02446 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SP4Q02446 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SP4Q02446 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SP4Q02446 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SP4Q02446 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SP4Q02446 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SP4Q02446 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SP4Q02446 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SP4Q02446 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SP4Q02446 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SP4Q02446 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SP4Q02446 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SP4Q02446 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SP4Q02446 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SP4Q02446 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SP4Q02446 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SP4Q02446 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SP4Q02446 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SP4Q02446 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SP4Q02446 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SP4Q02446 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SP4Q02446 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms