Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC17■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC17■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC17■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC17■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms