Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FANCCQ00597 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FANCCQ00597 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FANCCQ00597 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FANCCQ00597 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FANCCQ00597 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FANCCQ00597 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FANCCQ00597 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FANCCQ00597 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FANCCQ00597 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FANCCQ00597 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FANCCQ00597 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FANCCQ00597 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
FANCCQ00597 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FANCCQ00597 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FANCCQ00597 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FANCCQ00597 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FANCCQ00597 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FANCCQ00597 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FANCCQ00597 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FANCCQ00597 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FANCCQ00597 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FANCCQ00597 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FANCCQ00597 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FANCCQ00597 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FANCCQ00597 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FANCCQ00597 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FANCCQ00597 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FANCCQ00597 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FANCCQ00597 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FANCCQ00597 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FANCCQ00597 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FANCCQ00597 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FANCCQ00597 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FANCCQ00597 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FANCCQ00597 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FANCCQ00597 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
FANCCQ00597 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FANCCQ00597 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FANCCQ00597 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FANCCQ00597 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FANCCQ00597 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FANCCQ00597 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FANCCQ00597 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FANCCQ00597 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FANCCQ00597 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FANCCQ00597 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FANCCQ00597 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FANCCQ00597 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FANCCQ00597 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FANCCQ00597 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FANCCQ00597 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FANCCQ00597 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FANCCQ00597 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FANCCQ00597 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FANCCQ00597 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
FANCCQ00597 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
FANCCQ00597 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FANCCQ00597 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FANCCQ00597 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FANCCQ00597 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FANCCQ00597 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FANCCQ00597 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FANCCQ00597 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FANCCQ00597 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FANCCQ00597 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FANCCQ00597 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FANCCQ00597 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FANCCQ00597 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FANCCQ00597 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FANCCQ00597 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FANCCQ00597 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FANCCQ00597 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FANCCQ00597 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FANCCQ00597 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FANCCQ00597 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FANCCQ00597 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
FANCCQ00597 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FANCCQ00597 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FANCCQ00597 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FANCCQ00597 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FANCCQ00597 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FANCCQ00597 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FANCCQ00597 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FANCCQ00597 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FANCCQ00597 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FANCCQ00597 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FANCCQ00597 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FANCCQ00597 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FANCCQ00597 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FANCCQ00597 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FANCCQ00597 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FANCCQ00597 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FANCCQ00597 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
FANCCQ00597 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FANCCQ00597 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FANCCQ00597 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FANCCQ00597 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FANCCQ00597 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FANCCQ00597 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms