Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDKL1Q00532 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDKL1Q00532 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDKL1Q00532 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CDKL1Q00532 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDKL1Q00532 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDKL1Q00532 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDKL1Q00532 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDKL1Q00532 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDKL1Q00532 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDKL1Q00532 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDKL1Q00532 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDKL1Q00532 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDKL1Q00532 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDKL1Q00532 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDKL1Q00532 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDKL1Q00532 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDKL1Q00532 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDKL1Q00532 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDKL1Q00532 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDKL1Q00532 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDKL1Q00532 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CDKL1Q00532 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDKL1Q00532 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CDKL1Q00532 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDKL1Q00532 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDKL1Q00532 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDKL1Q00532 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDKL1Q00532 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDKL1Q00532 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDKL1Q00532 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDKL1Q00532 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDKL1Q00532 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDKL1Q00532 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDKL1Q00532 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDKL1Q00532 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDKL1Q00532 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDKL1Q00532 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDKL1Q00532 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDKL1Q00532 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDKL1Q00532 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDKL1Q00532 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDKL1Q00532 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDKL1Q00532 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDKL1Q00532 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDKL1Q00532 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDKL1Q00532 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDKL1Q00532 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDKL1Q00532 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDKL1Q00532 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDKL1Q00532 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDKL1Q00532 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDKL1Q00532 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDKL1Q00532 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDKL1Q00532 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDKL1Q00532 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDKL1Q00532 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDKL1Q00532 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDKL1Q00532 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDKL1Q00532 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDKL1Q00532 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDKL1Q00532 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDKL1Q00532 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDKL1Q00532 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDKL1Q00532 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDKL1Q00532 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDKL1Q00532 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDKL1Q00532 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDKL1Q00532 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDKL1Q00532 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDKL1Q00532 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDKL1Q00532 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDKL1Q00532 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDKL1Q00532 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CDKL1Q00532 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDKL1Q00532 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDKL1Q00532 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDKL1Q00532 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDKL1Q00532 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDKL1Q00532 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDKL1Q00532 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDKL1Q00532 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDKL1Q00532 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDKL1Q00532 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDKL1Q00532 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDKL1Q00532 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDKL1Q00532 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDKL1Q00532 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDKL1Q00532 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDKL1Q00532 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDKL1Q00532 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDKL1Q00532 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDKL1Q00532 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDKL1Q00532 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDKL1Q00532 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDKL1Q00532 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDKL1Q00532 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDKL1Q00532 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDKL1Q00532 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDKL1Q00532 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms