Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FGD1P98174 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FGD1P98174 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FGD1P98174 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FGD1P98174 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FGD1P98174 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FGD1P98174 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FGD1P98174 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FGD1P98174 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FGD1P98174 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FGD1P98174 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FGD1P98174 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FGD1P98174 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FGD1P98174 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FGD1P98174 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FGD1P98174 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FGD1P98174 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FGD1P98174 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FGD1P98174 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FGD1P98174 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FGD1P98174 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FGD1P98174 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FGD1P98174 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FGD1P98174 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FGD1P98174 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FGD1P98174 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FGD1P98174 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FGD1P98174 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FGD1P98174 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
FGD1P98174 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FGD1P98174 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FGD1P98174 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FGD1P98174 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FGD1P98174 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FGD1P98174 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FGD1P98174 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FGD1P98174 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FGD1P98174 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FGD1P98174 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FGD1P98174 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FGD1P98174 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
FGD1P98174 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
FGD1P98174 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
FGD1P98174 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
FGD1P98174 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FGD1P98174 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FGD1P98174 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
FGD1P98174 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FGD1P98174 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FGD1P98174 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FGD1P98174 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
FGD1P98174 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
FGD1P98174 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FGD1P98174 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FGD1P98174 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FGD1P98174 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FGD1P98174 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FGD1P98174 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FGD1P98174 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FGD1P98174 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FGD1P98174 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FGD1P98174 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FGD1P98174 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FGD1P98174 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FGD1P98174 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FGD1P98174 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FGD1P98174 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FGD1P98174 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FGD1P98174 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FGD1P98174 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FGD1P98174 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FGD1P98174 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FGD1P98174 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FGD1P98174 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FGD1P98174 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FGD1P98174 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FGD1P98174 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FGD1P98174 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FGD1P98174 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FGD1P98174 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FGD1P98174 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FGD1P98174 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FGD1P98174 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FGD1P98174 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FGD1P98174 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FGD1P98174 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FGD1P98174 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FGD1P98174 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FGD1P98174 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FGD1P98174 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FGD1P98174 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FGD1P98174 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FGD1P98174 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FGD1P98174 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FGD1P98174 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FGD1P98174 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FGD1P98174 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FGD1P98174 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FGD1P98174 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FGD1P98174 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms