Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CRB1P82279 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CRB1P82279 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CRB1P82279 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CRB1P82279 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CRB1P82279 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CRB1P82279 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CRB1P82279 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CRB1P82279 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CRB1P82279 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CRB1P82279 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CRB1P82279 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CRB1P82279 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CRB1P82279 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CRB1P82279 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CRB1P82279 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CRB1P82279 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CRB1P82279 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CRB1P82279 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CRB1P82279 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CRB1P82279 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CRB1P82279 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CRB1P82279 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CRB1P82279 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CRB1P82279 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CRB1P82279 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CRB1P82279 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CRB1P82279 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CRB1P82279 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CRB1P82279 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CRB1P82279 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CRB1P82279 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CRB1P82279 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CRB1P82279 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CRB1P82279 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CRB1P82279 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CRB1P82279 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CRB1P82279 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CRB1P82279 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CRB1P82279 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CRB1P82279 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CRB1P82279 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CRB1P82279 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CRB1P82279 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CRB1P82279 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CRB1P82279 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CRB1P82279 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CRB1P82279 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CRB1P82279 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CRB1P82279 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CRB1P82279 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CRB1P82279 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CRB1P82279 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CRB1P82279 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CRB1P82279 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CRB1P82279 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CRB1P82279 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CRB1P82279 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CRB1P82279 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CRB1P82279 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CRB1P82279 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CRB1P82279 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CRB1P82279 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CRB1P82279 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CRB1P82279 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CRB1P82279 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CRB1P82279 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CRB1P82279 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CRB1P82279 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CRB1P82279 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CRB1P82279 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CRB1P82279 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CRB1P82279 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CRB1P82279 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CRB1P82279 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CRB1P82279 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CRB1P82279 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CRB1P82279 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CRB1P82279 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CRB1P82279 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CRB1P82279 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CRB1P82279 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CRB1P82279 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CRB1P82279 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CRB1P82279 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CRB1P82279 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CRB1P82279 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CRB1P82279 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CRB1P82279 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CRB1P82279 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CRB1P82279 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CRB1P82279 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CRB1P82279 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CRB1P82279 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CRB1P82279 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CRB1P82279 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CRB1P82279 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CRB1P82279 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CRB1P82279 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CRB1P82279 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms