Protein–RNA interactions for Protein: P78396

CCNA1, Cyclin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA1P78396 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCNA1P78396 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCNA1P78396 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCNA1P78396 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCNA1P78396 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCNA1P78396 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCNA1P78396 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCNA1P78396 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCNA1P78396 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCNA1P78396 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNA1P78396 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNA1P78396 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNA1P78396 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNA1P78396 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNA1P78396 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNA1P78396 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNA1P78396 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNA1P78396 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNA1P78396 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNA1P78396 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNA1P78396 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNA1P78396 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNA1P78396 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNA1P78396 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNA1P78396 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNA1P78396 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNA1P78396 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNA1P78396 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNA1P78396 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNA1P78396 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNA1P78396 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNA1P78396 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNA1P78396 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNA1P78396 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNA1P78396 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNA1P78396 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNA1P78396 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNA1P78396 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCNA1P78396 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCNA1P78396 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CCNA1P78396 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCNA1P78396 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCNA1P78396 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCNA1P78396 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCNA1P78396 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCNA1P78396 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCNA1P78396 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCNA1P78396 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CCNA1P78396 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCNA1P78396 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCNA1P78396 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CCNA1P78396 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCNA1P78396 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCNA1P78396 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCNA1P78396 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCNA1P78396 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCNA1P78396 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CCNA1P78396 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCNA1P78396 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCNA1P78396 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CCNA1P78396 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCNA1P78396 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCNA1P78396 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CCNA1P78396 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCNA1P78396 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCNA1P78396 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCNA1P78396 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCNA1P78396 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCNA1P78396 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCNA1P78396 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCNA1P78396 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCNA1P78396 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCNA1P78396 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCNA1P78396 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCNA1P78396 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCNA1P78396 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCNA1P78396 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCNA1P78396 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCNA1P78396 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCNA1P78396 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCNA1P78396 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCNA1P78396 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCNA1P78396 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCNA1P78396 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCNA1P78396 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCNA1P78396 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCNA1P78396 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCNA1P78396 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCNA1P78396 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCNA1P78396 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCNA1P78396 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCNA1P78396 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CCNA1P78396 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CCNA1P78396 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCNA1P78396 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCNA1P78396 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCNA1P78396 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCNA1P78396 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCNA1P78396 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCNA1P78396 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms