Protein–RNA interactions for Protein: P78369

CLDN10, Claudin-10, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN10P78369 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDN10P78369 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDN10P78369 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDN10P78369 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDN10P78369 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDN10P78369 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDN10P78369 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDN10P78369 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDN10P78369 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDN10P78369 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDN10P78369 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDN10P78369 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDN10P78369 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDN10P78369 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDN10P78369 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDN10P78369 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLDN10P78369 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLDN10P78369 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLDN10P78369 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLDN10P78369 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLDN10P78369 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLDN10P78369 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLDN10P78369 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLDN10P78369 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLDN10P78369 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLDN10P78369 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CLDN10P78369 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLDN10P78369 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLDN10P78369 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLDN10P78369 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLDN10P78369 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLDN10P78369 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLDN10P78369 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN10P78369 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN10P78369 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN10P78369 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN10P78369 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN10P78369 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN10P78369 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN10P78369 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN10P78369 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN10P78369 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN10P78369 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDN10P78369 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDN10P78369 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDN10P78369 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDN10P78369 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDN10P78369 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDN10P78369 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDN10P78369 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDN10P78369 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLDN10P78369 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLDN10P78369 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLDN10P78369 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLDN10P78369 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLDN10P78369 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLDN10P78369 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CLDN10P78369 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLDN10P78369 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLDN10P78369 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLDN10P78369 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLDN10P78369 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLDN10P78369 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLDN10P78369 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLDN10P78369 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLDN10P78369 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDN10P78369 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDN10P78369 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDN10P78369 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDN10P78369 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDN10P78369 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDN10P78369 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDN10P78369 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDN10P78369 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDN10P78369 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDN10P78369 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDN10P78369 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDN10P78369 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDN10P78369 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDN10P78369 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDN10P78369 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDN10P78369 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDN10P78369 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN10P78369 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN10P78369 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN10P78369 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN10P78369 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN10P78369 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN10P78369 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN10P78369 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN10P78369 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN10P78369 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN10P78369 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN10P78369 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN10P78369 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN10P78369 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN10P78369 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDN10P78369 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDN10P78369 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDN10P78369 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms