Protein–RNA interactions for Protein: P69849

NOMO3, Nodal modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3P69849 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NOMO3P69849 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NOMO3P69849 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NOMO3P69849 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NOMO3P69849 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NOMO3P69849 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NOMO3P69849 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NOMO3P69849 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NOMO3P69849 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NOMO3P69849 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NOMO3P69849 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NOMO3P69849 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NOMO3P69849 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NOMO3P69849 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NOMO3P69849 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NOMO3P69849 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NOMO3P69849 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NOMO3P69849 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NOMO3P69849 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NOMO3P69849 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NOMO3P69849 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NOMO3P69849 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NOMO3P69849 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NOMO3P69849 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NOMO3P69849 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NOMO3P69849 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NOMO3P69849 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NOMO3P69849 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NOMO3P69849 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NOMO3P69849 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NOMO3P69849 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NOMO3P69849 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NOMO3P69849 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NOMO3P69849 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NOMO3P69849 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NOMO3P69849 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NOMO3P69849 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NOMO3P69849 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NOMO3P69849 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NOMO3P69849 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NOMO3P69849 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NOMO3P69849 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NOMO3P69849 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NOMO3P69849 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NOMO3P69849 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NOMO3P69849 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NOMO3P69849 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NOMO3P69849 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NOMO3P69849 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NOMO3P69849 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NOMO3P69849 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NOMO3P69849 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NOMO3P69849 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NOMO3P69849 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NOMO3P69849 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NOMO3P69849 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NOMO3P69849 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NOMO3P69849 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NOMO3P69849 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NOMO3P69849 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NOMO3P69849 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NOMO3P69849 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NOMO3P69849 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NOMO3P69849 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NOMO3P69849 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NOMO3P69849 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NOMO3P69849 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NOMO3P69849 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NOMO3P69849 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NOMO3P69849 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NOMO3P69849 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NOMO3P69849 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NOMO3P69849 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NOMO3P69849 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NOMO3P69849 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NOMO3P69849 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NOMO3P69849 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NOMO3P69849 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NOMO3P69849 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NOMO3P69849 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NOMO3P69849 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NOMO3P69849 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NOMO3P69849 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NOMO3P69849 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NOMO3P69849 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NOMO3P69849 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NOMO3P69849 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NOMO3P69849 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NOMO3P69849 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NOMO3P69849 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NOMO3P69849 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NOMO3P69849 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NOMO3P69849 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NOMO3P69849 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NOMO3P69849 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NOMO3P69849 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NOMO3P69849 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NOMO3P69849 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NOMO3P69849 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NOMO3P69849 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms