Protein–RNA interactions for Protein: P63145

ERVK-24, Endogenous retrovirus group K member 24 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-24P63145 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERVK-24P63145 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERVK-24P63145 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERVK-24P63145 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ERVK-24P63145 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERVK-24P63145 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERVK-24P63145 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERVK-24P63145 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ERVK-24P63145 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ERVK-24P63145 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERVK-24P63145 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERVK-24P63145 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERVK-24P63145 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERVK-24P63145 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERVK-24P63145 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ERVK-24P63145 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERVK-24P63145 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERVK-24P63145 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERVK-24P63145 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERVK-24P63145 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERVK-24P63145 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERVK-24P63145 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERVK-24P63145 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERVK-24P63145 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERVK-24P63145 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERVK-24P63145 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERVK-24P63145 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERVK-24P63145 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERVK-24P63145 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERVK-24P63145 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERVK-24P63145 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERVK-24P63145 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERVK-24P63145 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERVK-24P63145 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERVK-24P63145 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERVK-24P63145 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERVK-24P63145 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERVK-24P63145 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERVK-24P63145 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERVK-24P63145 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERVK-24P63145 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERVK-24P63145 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERVK-24P63145 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERVK-24P63145 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERVK-24P63145 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ERVK-24P63145 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERVK-24P63145 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ERVK-24P63145 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERVK-24P63145 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERVK-24P63145 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERVK-24P63145 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERVK-24P63145 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERVK-24P63145 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERVK-24P63145 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERVK-24P63145 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERVK-24P63145 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERVK-24P63145 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERVK-24P63145 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERVK-24P63145 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERVK-24P63145 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ERVK-24P63145 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERVK-24P63145 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERVK-24P63145 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERVK-24P63145 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERVK-24P63145 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERVK-24P63145 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERVK-24P63145 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERVK-24P63145 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERVK-24P63145 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ERVK-24P63145 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERVK-24P63145 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERVK-24P63145 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ERVK-24P63145 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERVK-24P63145 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERVK-24P63145 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERVK-24P63145 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERVK-24P63145 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ERVK-24P63145 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ERVK-24P63145 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
ERVK-24P63145 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ERVK-24P63145 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ERVK-24P63145 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ERVK-24P63145 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ERVK-24P63145 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ERVK-24P63145 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ERVK-24P63145 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ERVK-24P63145 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ERVK-24P63145 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ERVK-24P63145 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ERVK-24P63145 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ERVK-24P63145 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ERVK-24P63145 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ERVK-24P63145 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ERVK-24P63145 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ERVK-24P63145 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ERVK-24P63145 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ERVK-24P63145 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ERVK-24P63145 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ERVK-24P63145 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERVK-24P63145 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms