Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HERVK_113P63132 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
HERVK_113P63132 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HERVK_113P63132 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HERVK_113P63132 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HERVK_113P63132 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HERVK_113P63132 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HERVK_113P63132 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
HERVK_113P63132 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HERVK_113P63132 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HERVK_113P63132 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HERVK_113P63132 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HERVK_113P63132 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HERVK_113P63132 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HERVK_113P63132 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HERVK_113P63132 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HERVK_113P63132 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HERVK_113P63132 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HERVK_113P63132 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HERVK_113P63132 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HERVK_113P63132 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HERVK_113P63132 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
HERVK_113P63132 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HERVK_113P63132 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HERVK_113P63132 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HERVK_113P63132 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
HERVK_113P63132 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HERVK_113P63132 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HERVK_113P63132 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HERVK_113P63132 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HERVK_113P63132 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HERVK_113P63132 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HERVK_113P63132 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HERVK_113P63132 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HERVK_113P63132 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HERVK_113P63132 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
HERVK_113P63132 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
HERVK_113P63132 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
HERVK_113P63132 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERVK_113P63132 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERVK_113P63132 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERVK_113P63132 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
HERVK_113P63132 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERVK_113P63132 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
HERVK_113P63132 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
HERVK_113P63132 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERVK_113P63132 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERVK_113P63132 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERVK_113P63132 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERVK_113P63132 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERVK_113P63132 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERVK_113P63132 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERVK_113P63132 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERVK_113P63132 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
HERVK_113P63132 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERVK_113P63132 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERVK_113P63132 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERVK_113P63132 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HERVK_113P63132 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERVK_113P63132 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERVK_113P63132 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HERVK_113P63132 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERVK_113P63132 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HERVK_113P63132 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERVK_113P63132 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HERVK_113P63132 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERVK_113P63132 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERVK_113P63132 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERVK_113P63132 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERVK_113P63132 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERVK_113P63132 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERVK_113P63132 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERVK_113P63132 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERVK_113P63132 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERVK_113P63132 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERVK_113P63132 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERVK_113P63132 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERVK_113P63132 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HERVK_113P63132 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HERVK_113P63132 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERVK_113P63132 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERVK_113P63132 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERVK_113P63132 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERVK_113P63132 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERVK_113P63132 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERVK_113P63132 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERVK_113P63132 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERVK_113P63132 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERVK_113P63132 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERVK_113P63132 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HERVK_113P63132 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERVK_113P63132 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERVK_113P63132 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERVK_113P63132 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERVK_113P63132 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERVK_113P63132 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERVK_113P63132 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERVK_113P63132 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERVK_113P63132 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HERVK_113P63132 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms