Protein–RNA interactions for Protein: P62851

RPS25, 40S ribosomal protein S25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS25P62851 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPS25P62851 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPS25P62851 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPS25P62851 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPS25P62851 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPS25P62851 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPS25P62851 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPS25P62851 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPS25P62851 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPS25P62851 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPS25P62851 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RPS25P62851 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPS25P62851 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPS25P62851 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPS25P62851 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPS25P62851 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPS25P62851 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPS25P62851 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPS25P62851 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPS25P62851 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPS25P62851 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPS25P62851 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPS25P62851 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPS25P62851 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPS25P62851 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RPS25P62851 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPS25P62851 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPS25P62851 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPS25P62851 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPS25P62851 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPS25P62851 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPS25P62851 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPS25P62851 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPS25P62851 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPS25P62851 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPS25P62851 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPS25P62851 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RPS25P62851 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPS25P62851 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPS25P62851 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPS25P62851 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPS25P62851 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPS25P62851 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPS25P62851 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPS25P62851 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPS25P62851 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPS25P62851 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RPS25P62851 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RPS25P62851 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RPS25P62851 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPS25P62851 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPS25P62851 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPS25P62851 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPS25P62851 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPS25P62851 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPS25P62851 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RPS25P62851 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPS25P62851 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPS25P62851 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPS25P62851 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPS25P62851 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPS25P62851 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPS25P62851 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPS25P62851 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPS25P62851 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPS25P62851 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPS25P62851 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPS25P62851 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPS25P62851 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPS25P62851 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPS25P62851 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPS25P62851 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPS25P62851 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPS25P62851 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPS25P62851 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPS25P62851 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPS25P62851 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPS25P62851 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPS25P62851 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPS25P62851 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPS25P62851 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPS25P62851 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPS25P62851 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPS25P62851 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPS25P62851 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPS25P62851 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPS25P62851 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPS25P62851 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPS25P62851 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPS25P62851 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPS25P62851 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPS25P62851 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPS25P62851 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPS25P62851 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPS25P62851 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPS25P62851 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPS25P62851 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPS25P62851 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPS25P62851 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPS25P62851 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms