Protein–RNA interactions for Protein: P62277

RPS13, 40S ribosomal protein S13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS13P62277 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPS13P62277 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPS13P62277 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPS13P62277 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPS13P62277 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPS13P62277 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPS13P62277 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPS13P62277 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPS13P62277 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPS13P62277 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPS13P62277 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPS13P62277 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPS13P62277 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RPS13P62277 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPS13P62277 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPS13P62277 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPS13P62277 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPS13P62277 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPS13P62277 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RPS13P62277 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPS13P62277 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPS13P62277 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPS13P62277 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPS13P62277 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPS13P62277 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPS13P62277 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPS13P62277 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPS13P62277 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPS13P62277 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RPS13P62277 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPS13P62277 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPS13P62277 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPS13P62277 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPS13P62277 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPS13P62277 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPS13P62277 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPS13P62277 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPS13P62277 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPS13P62277 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPS13P62277 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPS13P62277 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPS13P62277 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPS13P62277 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPS13P62277 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RPS13P62277 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPS13P62277 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPS13P62277 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPS13P62277 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPS13P62277 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RPS13P62277 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPS13P62277 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPS13P62277 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPS13P62277 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPS13P62277 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPS13P62277 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPS13P62277 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RPS13P62277 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPS13P62277 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPS13P62277 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPS13P62277 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPS13P62277 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPS13P62277 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPS13P62277 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPS13P62277 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPS13P62277 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPS13P62277 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPS13P62277 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPS13P62277 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPS13P62277 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPS13P62277 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPS13P62277 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPS13P62277 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPS13P62277 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPS13P62277 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPS13P62277 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPS13P62277 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPS13P62277 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPS13P62277 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RPS13P62277 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPS13P62277 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPS13P62277 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RPS13P62277 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPS13P62277 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPS13P62277 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPS13P62277 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPS13P62277 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPS13P62277 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPS13P62277 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPS13P62277 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPS13P62277 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPS13P62277 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RPS13P62277 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPS13P62277 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPS13P62277 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPS13P62277 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPS13P62277 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPS13P62277 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RPS13P62277 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPS13P62277 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPS13P62277 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms