Protein–RNA interactions for Protein: P62256

UBE2H, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 H, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2HP62256 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE2HP62256 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE2HP62256 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE2HP62256 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE2HP62256 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE2HP62256 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE2HP62256 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE2HP62256 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE2HP62256 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE2HP62256 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE2HP62256 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE2HP62256 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE2HP62256 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE2HP62256 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE2HP62256 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE2HP62256 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE2HP62256 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE2HP62256 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE2HP62256 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE2HP62256 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE2HP62256 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE2HP62256 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE2HP62256 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE2HP62256 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE2HP62256 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE2HP62256 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE2HP62256 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE2HP62256 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBE2HP62256 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
UBE2HP62256 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
UBE2HP62256 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBE2HP62256 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
UBE2HP62256 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24■■□□□ 1.43
UBE2HP62256 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBE2HP62256 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBE2HP62256 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBE2HP62256 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBE2HP62256 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBE2HP62256 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
UBE2HP62256 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBE2HP62256 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBE2HP62256 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBE2HP62256 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
UBE2HP62256 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE2HP62256 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE2HP62256 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE2HP62256 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE2HP62256 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE2HP62256 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE2HP62256 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE2HP62256 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE2HP62256 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE2HP62256 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE2HP62256 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE2HP62256 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE2HP62256 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE2HP62256 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE2HP62256 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE2HP62256 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE2HP62256 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE2HP62256 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE2HP62256 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE2HP62256 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE2HP62256 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE2HP62256 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE2HP62256 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE2HP62256 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE2HP62256 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE2HP62256 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE2HP62256 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE2HP62256 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE2HP62256 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE2HP62256 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE2HP62256 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE2HP62256 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE2HP62256 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE2HP62256 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE2HP62256 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE2HP62256 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE2HP62256 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE2HP62256 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE2HP62256 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE2HP62256 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE2HP62256 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE2HP62256 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE2HP62256 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE2HP62256 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE2HP62256 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE2HP62256 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE2HP62256 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE2HP62256 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE2HP62256 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE2HP62256 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE2HP62256 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE2HP62256 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
UBE2HP62256 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
UBE2HP62256 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
UBE2HP62256 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBE2HP62256 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBE2HP62256 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms