Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVFC1P60507 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVFC1P60507 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVFC1P60507 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVFC1P60507 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVFC1P60507 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVFC1P60507 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVFC1P60507 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVFC1P60507 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVFC1P60507 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVFC1P60507 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVFC1P60507 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVFC1P60507 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVFC1P60507 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVFC1P60507 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVFC1P60507 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVFC1P60507 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVFC1P60507 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVFC1P60507 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVFC1P60507 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVFC1P60507 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVFC1P60507 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVFC1P60507 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVFC1P60507 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVFC1P60507 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVFC1P60507 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVFC1P60507 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVFC1P60507 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVFC1P60507 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVFC1P60507 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVFC1P60507 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVFC1P60507 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVFC1P60507 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVFC1P60507 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVFC1P60507 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVFC1P60507 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVFC1P60507 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVFC1P60507 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVFC1P60507 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVFC1P60507 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVFC1P60507 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVFC1P60507 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVFC1P60507 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVFC1P60507 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVFC1P60507 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVFC1P60507 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVFC1P60507 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVFC1P60507 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVFC1P60507 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVFC1P60507 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVFC1P60507 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVFC1P60507 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVFC1P60507 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVFC1P60507 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVFC1P60507 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVFC1P60507 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVFC1P60507 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVFC1P60507 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVFC1P60507 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVFC1P60507 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVFC1P60507 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVFC1P60507 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVFC1P60507 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVFC1P60507 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVFC1P60507 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVFC1P60507 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVFC1P60507 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVFC1P60507 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVFC1P60507 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVFC1P60507 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVFC1P60507 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVFC1P60507 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVFC1P60507 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVFC1P60507 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVFC1P60507 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVFC1P60507 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVFC1P60507 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVFC1P60507 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVFC1P60507 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVFC1P60507 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVFC1P60507 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVFC1P60507 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVFC1P60507 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVFC1P60507 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVFC1P60507 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVFC1P60507 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVFC1P60507 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVFC1P60507 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVFC1P60507 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVFC1P60507 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVFC1P60507 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVFC1P60507 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVFC1P60507 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVFC1P60507 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVFC1P60507 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVFC1P60507 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVFC1P60507 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVFC1P60507 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVFC1P60507 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVFC1P60507 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms