Protein–RNA interactions for Protein: P59074

CHMP4BP1, Putative charged multivesicular body protein 4B-like protein CHMP4BP1, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4BP1P59074 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP4BP1P59074 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP4BP1P59074 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP4BP1P59074 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP4BP1P59074 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP4BP1P59074 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP4BP1P59074 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP4BP1P59074 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP4BP1P59074 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP4BP1P59074 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP4BP1P59074 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP4BP1P59074 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP4BP1P59074 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP4BP1P59074 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP4BP1P59074 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP4BP1P59074 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMP4BP1P59074 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMP4BP1P59074 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMP4BP1P59074 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMP4BP1P59074 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMP4BP1P59074 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMP4BP1P59074 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMP4BP1P59074 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMP4BP1P59074 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMP4BP1P59074 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMP4BP1P59074 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMP4BP1P59074 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMP4BP1P59074 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP4BP1P59074 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP4BP1P59074 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP4BP1P59074 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP4BP1P59074 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP4BP1P59074 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP4BP1P59074 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP4BP1P59074 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP4BP1P59074 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP4BP1P59074 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP4BP1P59074 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP4BP1P59074 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP4BP1P59074 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP4BP1P59074 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP4BP1P59074 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP4BP1P59074 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP4BP1P59074 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP4BP1P59074 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP4BP1P59074 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP4BP1P59074 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP4BP1P59074 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP4BP1P59074 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP4BP1P59074 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP4BP1P59074 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMP4BP1P59074 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMP4BP1P59074 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMP4BP1P59074 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMP4BP1P59074 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMP4BP1P59074 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMP4BP1P59074 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMP4BP1P59074 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMP4BP1P59074 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHMP4BP1P59074 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHMP4BP1P59074 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHMP4BP1P59074 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHMP4BP1P59074 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHMP4BP1P59074 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHMP4BP1P59074 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHMP4BP1P59074 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHMP4BP1P59074 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHMP4BP1P59074 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHMP4BP1P59074 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHMP4BP1P59074 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHMP4BP1P59074 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHMP4BP1P59074 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHMP4BP1P59074 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHMP4BP1P59074 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHMP4BP1P59074 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHMP4BP1P59074 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHMP4BP1P59074 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHMP4BP1P59074 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHMP4BP1P59074 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHMP4BP1P59074 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHMP4BP1P59074 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHMP4BP1P59074 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHMP4BP1P59074 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMP4BP1P59074 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMP4BP1P59074 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMP4BP1P59074 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMP4BP1P59074 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMP4BP1P59074 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMP4BP1P59074 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMP4BP1P59074 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMP4BP1P59074 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMP4BP1P59074 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMP4BP1P59074 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMP4BP1P59074 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMP4BP1P59074 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMP4BP1P59074 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMP4BP1P59074 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMP4BP1P59074 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMP4BP1P59074 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMP4BP1P59074 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms