Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RHBDL3P58872 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RHBDL3P58872 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RHBDL3P58872 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RHBDL3P58872 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RHBDL3P58872 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RHBDL3P58872 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RHBDL3P58872 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RHBDL3P58872 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RHBDL3P58872 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RHBDL3P58872 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RHBDL3P58872 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RHBDL3P58872 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RHBDL3P58872 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RHBDL3P58872 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RHBDL3P58872 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RHBDL3P58872 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RHBDL3P58872 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RHBDL3P58872 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RHBDL3P58872 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RHBDL3P58872 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RHBDL3P58872 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RHBDL3P58872 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RHBDL3P58872 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RHBDL3P58872 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RHBDL3P58872 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RHBDL3P58872 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RHBDL3P58872 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RHBDL3P58872 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RHBDL3P58872 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RHBDL3P58872 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RHBDL3P58872 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RHBDL3P58872 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RHBDL3P58872 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RHBDL3P58872 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RHBDL3P58872 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RHBDL3P58872 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RHBDL3P58872 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RHBDL3P58872 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RHBDL3P58872 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RHBDL3P58872 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RHBDL3P58872 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RHBDL3P58872 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RHBDL3P58872 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RHBDL3P58872 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RHBDL3P58872 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RHBDL3P58872 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RHBDL3P58872 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RHBDL3P58872 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RHBDL3P58872 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RHBDL3P58872 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RHBDL3P58872 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RHBDL3P58872 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RHBDL3P58872 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RHBDL3P58872 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RHBDL3P58872 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RHBDL3P58872 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RHBDL3P58872 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RHBDL3P58872 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RHBDL3P58872 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RHBDL3P58872 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RHBDL3P58872 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RHBDL3P58872 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RHBDL3P58872 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RHBDL3P58872 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RHBDL3P58872 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RHBDL3P58872 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RHBDL3P58872 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RHBDL3P58872 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RHBDL3P58872 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RHBDL3P58872 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RHBDL3P58872 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RHBDL3P58872 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
RHBDL3P58872 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RHBDL3P58872 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
RHBDL3P58872 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RHBDL3P58872 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RHBDL3P58872 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RHBDL3P58872 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RHBDL3P58872 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RHBDL3P58872 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RHBDL3P58872 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RHBDL3P58872 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RHBDL3P58872 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RHBDL3P58872 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RHBDL3P58872 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RHBDL3P58872 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RHBDL3P58872 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RHBDL3P58872 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RHBDL3P58872 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RHBDL3P58872 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RHBDL3P58872 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RHBDL3P58872 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RHBDL3P58872 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RHBDL3P58872 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RHBDL3P58872 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RHBDL3P58872 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RHBDL3P58872 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RHBDL3P58872 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RHBDL3P58872 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms