Protein–RNA interactions for Protein: P57764

GSDMD, Gasdermin-D, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMDP57764 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GSDMDP57764 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GSDMDP57764 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GSDMDP57764 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GSDMDP57764 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GSDMDP57764 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GSDMDP57764 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GSDMDP57764 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GSDMDP57764 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GSDMDP57764 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GSDMDP57764 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GSDMDP57764 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GSDMDP57764 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GSDMDP57764 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GSDMDP57764 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GSDMDP57764 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GSDMDP57764 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GSDMDP57764 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GSDMDP57764 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GSDMDP57764 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GSDMDP57764 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GSDMDP57764 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GSDMDP57764 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GSDMDP57764 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GSDMDP57764 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GSDMDP57764 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
GSDMDP57764 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GSDMDP57764 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GSDMDP57764 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GSDMDP57764 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GSDMDP57764 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GSDMDP57764 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GSDMDP57764 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GSDMDP57764 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GSDMDP57764 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GSDMDP57764 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GSDMDP57764 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GSDMDP57764 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GSDMDP57764 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GSDMDP57764 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GSDMDP57764 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GSDMDP57764 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GSDMDP57764 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GSDMDP57764 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GSDMDP57764 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GSDMDP57764 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GSDMDP57764 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GSDMDP57764 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GSDMDP57764 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GSDMDP57764 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GSDMDP57764 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GSDMDP57764 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GSDMDP57764 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GSDMDP57764 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GSDMDP57764 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GSDMDP57764 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GSDMDP57764 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GSDMDP57764 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GSDMDP57764 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GSDMDP57764 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GSDMDP57764 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GSDMDP57764 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GSDMDP57764 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GSDMDP57764 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GSDMDP57764 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GSDMDP57764 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GSDMDP57764 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GSDMDP57764 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GSDMDP57764 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GSDMDP57764 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GSDMDP57764 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GSDMDP57764 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GSDMDP57764 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GSDMDP57764 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GSDMDP57764 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GSDMDP57764 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GSDMDP57764 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GSDMDP57764 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GSDMDP57764 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GSDMDP57764 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GSDMDP57764 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GSDMDP57764 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GSDMDP57764 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GSDMDP57764 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GSDMDP57764 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GSDMDP57764 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GSDMDP57764 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GSDMDP57764 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GSDMDP57764 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GSDMDP57764 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GSDMDP57764 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GSDMDP57764 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GSDMDP57764 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GSDMDP57764 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GSDMDP57764 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GSDMDP57764 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GSDMDP57764 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GSDMDP57764 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GSDMDP57764 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GSDMDP57764 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms