Protein–RNA interactions for Protein: P56962

STX17, Syntaxin-17, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX17P56962 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
STX17P56962 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
STX17P56962 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
STX17P56962 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
STX17P56962 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
STX17P56962 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
STX17P56962 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
STX17P56962 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
STX17P56962 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
STX17P56962 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
STX17P56962 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
STX17P56962 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
STX17P56962 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
STX17P56962 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
STX17P56962 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
STX17P56962 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STX17P56962 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
STX17P56962 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STX17P56962 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STX17P56962 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STX17P56962 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
STX17P56962 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STX17P56962 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
STX17P56962 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
STX17P56962 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STX17P56962 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STX17P56962 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
STX17P56962 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STX17P56962 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STX17P56962 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
STX17P56962 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
STX17P56962 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
STX17P56962 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
STX17P56962 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
STX17P56962 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
STX17P56962 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
STX17P56962 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
STX17P56962 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
STX17P56962 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
STX17P56962 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
STX17P56962 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
STX17P56962 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
STX17P56962 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
STX17P56962 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
STX17P56962 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
STX17P56962 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
STX17P56962 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
STX17P56962 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
STX17P56962 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
STX17P56962 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
STX17P56962 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
STX17P56962 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
STX17P56962 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
STX17P56962 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
STX17P56962 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
STX17P56962 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
STX17P56962 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
STX17P56962 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
STX17P56962 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
STX17P56962 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
STX17P56962 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
STX17P56962 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
STX17P56962 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
STX17P56962 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
STX17P56962 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
STX17P56962 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
STX17P56962 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
STX17P56962 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
STX17P56962 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
STX17P56962 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
STX17P56962 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
STX17P56962 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
STX17P56962 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
STX17P56962 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STX17P56962 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STX17P56962 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STX17P56962 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STX17P56962 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STX17P56962 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
STX17P56962 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
STX17P56962 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
STX17P56962 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
STX17P56962 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
STX17P56962 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
STX17P56962 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
STX17P56962 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
STX17P56962 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
STX17P56962 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
STX17P56962 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STX17P56962 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STX17P56962 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STX17P56962 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
STX17P56962 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STX17P56962 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
STX17P56962 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
STX17P56962 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
STX17P56962 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
STX17P56962 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
STX17P56962 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
STX17P56962 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms