Protein–RNA interactions for Protein: P56559

ARL4C, ADP-ribosylation factor-like protein 4C, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL4CP56559 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARL4CP56559 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARL4CP56559 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARL4CP56559 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARL4CP56559 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARL4CP56559 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARL4CP56559 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARL4CP56559 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARL4CP56559 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARL4CP56559 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARL4CP56559 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARL4CP56559 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARL4CP56559 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARL4CP56559 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARL4CP56559 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARL4CP56559 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARL4CP56559 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARL4CP56559 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARL4CP56559 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARL4CP56559 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARL4CP56559 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARL4CP56559 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARL4CP56559 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARL4CP56559 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARL4CP56559 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARL4CP56559 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARL4CP56559 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARL4CP56559 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARL4CP56559 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARL4CP56559 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARL4CP56559 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARL4CP56559 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARL4CP56559 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARL4CP56559 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARL4CP56559 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARL4CP56559 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARL4CP56559 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARL4CP56559 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARL4CP56559 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARL4CP56559 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARL4CP56559 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARL4CP56559 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARL4CP56559 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARL4CP56559 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARL4CP56559 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARL4CP56559 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ARL4CP56559 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ARL4CP56559 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ARL4CP56559 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ARL4CP56559 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ARL4CP56559 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARL4CP56559 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARL4CP56559 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ARL4CP56559 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARL4CP56559 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ARL4CP56559 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARL4CP56559 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARL4CP56559 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARL4CP56559 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARL4CP56559 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARL4CP56559 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARL4CP56559 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARL4CP56559 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARL4CP56559 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARL4CP56559 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARL4CP56559 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARL4CP56559 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARL4CP56559 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARL4CP56559 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARL4CP56559 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ARL4CP56559 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARL4CP56559 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARL4CP56559 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARL4CP56559 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARL4CP56559 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARL4CP56559 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARL4CP56559 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARL4CP56559 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARL4CP56559 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARL4CP56559 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARL4CP56559 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARL4CP56559 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARL4CP56559 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARL4CP56559 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARL4CP56559 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARL4CP56559 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARL4CP56559 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARL4CP56559 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARL4CP56559 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARL4CP56559 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARL4CP56559 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARL4CP56559 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARL4CP56559 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARL4CP56559 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARL4CP56559 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARL4CP56559 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARL4CP56559 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARL4CP56559 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARL4CP56559 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARL4CP56559 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms