Protein–RNA interactions for Protein: P56182

RRP1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1P56182 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
RRP1P56182 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RRP1P56182 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RRP1P56182 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RRP1P56182 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RRP1P56182 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
RRP1P56182 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RRP1P56182 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RRP1P56182 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RRP1P56182 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RRP1P56182 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
RRP1P56182 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RRP1P56182 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RRP1P56182 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RRP1P56182 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RRP1P56182 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RRP1P56182 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RRP1P56182 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RRP1P56182 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RRP1P56182 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RRP1P56182 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RRP1P56182 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RRP1P56182 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RRP1P56182 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RRP1P56182 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RRP1P56182 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RRP1P56182 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RRP1P56182 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RRP1P56182 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RRP1P56182 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RRP1P56182 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RRP1P56182 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RRP1P56182 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RRP1P56182 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RRP1P56182 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RRP1P56182 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RRP1P56182 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RRP1P56182 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RRP1P56182 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RRP1P56182 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RRP1P56182 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RRP1P56182 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RRP1P56182 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RRP1P56182 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RRP1P56182 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RRP1P56182 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RRP1P56182 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
RRP1P56182 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RRP1P56182 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RRP1P56182 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RRP1P56182 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
RRP1P56182 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RRP1P56182 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
RRP1P56182 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RRP1P56182 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RRP1P56182 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RRP1P56182 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RRP1P56182 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RRP1P56182 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RRP1P56182 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RRP1P56182 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RRP1P56182 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RRP1P56182 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RRP1P56182 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RRP1P56182 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RRP1P56182 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RRP1P56182 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RRP1P56182 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RRP1P56182 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RRP1P56182 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RRP1P56182 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RRP1P56182 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RRP1P56182 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RRP1P56182 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RRP1P56182 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RRP1P56182 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RRP1P56182 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RRP1P56182 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RRP1P56182 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RRP1P56182 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RRP1P56182 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RRP1P56182 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RRP1P56182 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RRP1P56182 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RRP1P56182 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RRP1P56182 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RRP1P56182 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RRP1P56182 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RRP1P56182 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RRP1P56182 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RRP1P56182 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RRP1P56182 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
RRP1P56182 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RRP1P56182 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RRP1P56182 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RRP1P56182 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RRP1P56182 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RRP1P56182 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RRP1P56182 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC27■■□□□ 1.91
RRP1P56182 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms