Protein–RNA interactions for Protein: P55809

OXCT1, Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OXCT1P55809 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
OXCT1P55809 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
OXCT1P55809 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
OXCT1P55809 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
OXCT1P55809 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
OXCT1P55809 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
OXCT1P55809 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
OXCT1P55809 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
OXCT1P55809 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
OXCT1P55809 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
OXCT1P55809 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
OXCT1P55809 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
OXCT1P55809 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
OXCT1P55809 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
OXCT1P55809 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
OXCT1P55809 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
OXCT1P55809 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
OXCT1P55809 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
OXCT1P55809 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
OXCT1P55809 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
OXCT1P55809 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
OXCT1P55809 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
OXCT1P55809 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
OXCT1P55809 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
OXCT1P55809 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
OXCT1P55809 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
OXCT1P55809 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
OXCT1P55809 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
OXCT1P55809 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
OXCT1P55809 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
OXCT1P55809 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
OXCT1P55809 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
OXCT1P55809 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
OXCT1P55809 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
OXCT1P55809 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
OXCT1P55809 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
OXCT1P55809 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
OXCT1P55809 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
OXCT1P55809 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
OXCT1P55809 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
OXCT1P55809 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
OXCT1P55809 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
OXCT1P55809 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
OXCT1P55809 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
OXCT1P55809 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
OXCT1P55809 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
OXCT1P55809 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
OXCT1P55809 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
OXCT1P55809 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
OXCT1P55809 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
OXCT1P55809 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
OXCT1P55809 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
OXCT1P55809 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
OXCT1P55809 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
OXCT1P55809 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
OXCT1P55809 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
OXCT1P55809 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
OXCT1P55809 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
OXCT1P55809 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
OXCT1P55809 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
OXCT1P55809 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
OXCT1P55809 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
OXCT1P55809 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
OXCT1P55809 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
OXCT1P55809 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
OXCT1P55809 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
OXCT1P55809 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
OXCT1P55809 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
OXCT1P55809 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
OXCT1P55809 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
OXCT1P55809 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
OXCT1P55809 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
OXCT1P55809 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
OXCT1P55809 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
OXCT1P55809 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
OXCT1P55809 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
OXCT1P55809 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
OXCT1P55809 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
OXCT1P55809 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
OXCT1P55809 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
OXCT1P55809 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
OXCT1P55809 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
OXCT1P55809 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
OXCT1P55809 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
OXCT1P55809 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
OXCT1P55809 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
OXCT1P55809 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
OXCT1P55809 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
OXCT1P55809 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
OXCT1P55809 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
OXCT1P55809 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
OXCT1P55809 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
OXCT1P55809 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
OXCT1P55809 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
OXCT1P55809 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
OXCT1P55809 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
OXCT1P55809 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
OXCT1P55809 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
OXCT1P55809 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
OXCT1P55809 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 253.7 ms