Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HIRAP54198 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HIRAP54198 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HIRAP54198 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HIRAP54198 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HIRAP54198 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HIRAP54198 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HIRAP54198 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
HIRAP54198 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HIRAP54198 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HIRAP54198 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HIRAP54198 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HIRAP54198 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HIRAP54198 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HIRAP54198 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HIRAP54198 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HIRAP54198 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HIRAP54198 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HIRAP54198 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HIRAP54198 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HIRAP54198 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HIRAP54198 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HIRAP54198 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HIRAP54198 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
HIRAP54198 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HIRAP54198 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HIRAP54198 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HIRAP54198 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HIRAP54198 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HIRAP54198 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
HIRAP54198 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HIRAP54198 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HIRAP54198 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
HIRAP54198 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
HIRAP54198 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HIRAP54198 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HIRAP54198 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HIRAP54198 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HIRAP54198 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HIRAP54198 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HIRAP54198 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HIRAP54198 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HIRAP54198 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HIRAP54198 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HIRAP54198 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HIRAP54198 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HIRAP54198 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HIRAP54198 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HIRAP54198 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HIRAP54198 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
HIRAP54198 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HIRAP54198 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HIRAP54198 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HIRAP54198 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HIRAP54198 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HIRAP54198 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HIRAP54198 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HIRAP54198 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HIRAP54198 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HIRAP54198 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HIRAP54198 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HIRAP54198 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HIRAP54198 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HIRAP54198 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HIRAP54198 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HIRAP54198 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HIRAP54198 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HIRAP54198 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HIRAP54198 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HIRAP54198 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HIRAP54198 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
HIRAP54198 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HIRAP54198 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HIRAP54198 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HIRAP54198 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HIRAP54198 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HIRAP54198 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HIRAP54198 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
HIRAP54198 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HIRAP54198 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HIRAP54198 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HIRAP54198 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HIRAP54198 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HIRAP54198 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HIRAP54198 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
HIRAP54198 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HIRAP54198 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HIRAP54198 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
HIRAP54198 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HIRAP54198 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HIRAP54198 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HIRAP54198 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HIRAP54198 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HIRAP54198 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HIRAP54198 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HIRAP54198 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HIRAP54198 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HIRAP54198 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HIRAP54198 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HIRAP54198 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms