Protein–RNA interactions for Protein: P52815

MRPL12, 39S ribosomal protein L12, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL12P52815 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRPL12P52815 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRPL12P52815 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRPL12P52815 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRPL12P52815 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRPL12P52815 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRPL12P52815 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRPL12P52815 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRPL12P52815 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRPL12P52815 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRPL12P52815 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRPL12P52815 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRPL12P52815 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRPL12P52815 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MRPL12P52815 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MRPL12P52815 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MRPL12P52815 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MRPL12P52815 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MRPL12P52815 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MRPL12P52815 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MRPL12P52815 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MRPL12P52815 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MRPL12P52815 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MRPL12P52815 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MRPL12P52815 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MRPL12P52815 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MRPL12P52815 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MRPL12P52815 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MRPL12P52815 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MRPL12P52815 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
MRPL12P52815 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
MRPL12P52815 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MRPL12P52815 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MRPL12P52815 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MRPL12P52815 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MRPL12P52815 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MRPL12P52815 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MRPL12P52815 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MRPL12P52815 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MRPL12P52815 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MRPL12P52815 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MRPL12P52815 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MRPL12P52815 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MRPL12P52815 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRPL12P52815 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRPL12P52815 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRPL12P52815 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRPL12P52815 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MRPL12P52815 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRPL12P52815 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRPL12P52815 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRPL12P52815 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRPL12P52815 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRPL12P52815 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRPL12P52815 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRPL12P52815 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRPL12P52815 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRPL12P52815 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRPL12P52815 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRPL12P52815 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRPL12P52815 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRPL12P52815 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRPL12P52815 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRPL12P52815 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MRPL12P52815 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRPL12P52815 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRPL12P52815 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRPL12P52815 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRPL12P52815 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRPL12P52815 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRPL12P52815 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRPL12P52815 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRPL12P52815 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MRPL12P52815 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRPL12P52815 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRPL12P52815 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRPL12P52815 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRPL12P52815 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRPL12P52815 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRPL12P52815 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRPL12P52815 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRPL12P52815 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRPL12P52815 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRPL12P52815 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRPL12P52815 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRPL12P52815 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRPL12P52815 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRPL12P52815 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRPL12P52815 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRPL12P52815 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRPL12P52815 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRPL12P52815 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRPL12P52815 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRPL12P52815 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRPL12P52815 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRPL12P52815 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRPL12P52815 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRPL12P52815 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MRPL12P52815 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MRPL12P52815 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms