Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRCA2P51587 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRCA2P51587 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
BRCA2P51587 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRCA2P51587 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRCA2P51587 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRCA2P51587 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRCA2P51587 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRCA2P51587 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRCA2P51587 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRCA2P51587 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRCA2P51587 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRCA2P51587 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
BRCA2P51587 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRCA2P51587 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRCA2P51587 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRCA2P51587 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRCA2P51587 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
BRCA2P51587 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRCA2P51587 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
BRCA2P51587 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BRCA2P51587 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BRCA2P51587 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
BRCA2P51587 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BRCA2P51587 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BRCA2P51587 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
BRCA2P51587 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BRCA2P51587 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BRCA2P51587 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BRCA2P51587 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRCA2P51587 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRCA2P51587 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRCA2P51587 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRCA2P51587 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRCA2P51587 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRCA2P51587 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRCA2P51587 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRCA2P51587 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRCA2P51587 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRCA2P51587 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BRCA2P51587 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BRCA2P51587 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BRCA2P51587 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BRCA2P51587 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
BRCA2P51587 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BRCA2P51587 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BRCA2P51587 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BRCA2P51587 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
BRCA2P51587 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.39
BRCA2P51587 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRCA2P51587 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRCA2P51587 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
BRCA2P51587 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRCA2P51587 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
BRCA2P51587 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRCA2P51587 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRCA2P51587 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
BRCA2P51587 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRCA2P51587 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRCA2P51587 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
BRCA2P51587 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRCA2P51587 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRCA2P51587 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRCA2P51587 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRCA2P51587 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRCA2P51587 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRCA2P51587 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRCA2P51587 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRCA2P51587 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRCA2P51587 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRCA2P51587 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRCA2P51587 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRCA2P51587 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRCA2P51587 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRCA2P51587 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRCA2P51587 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRCA2P51587 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRCA2P51587 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRCA2P51587 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRCA2P51587 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRCA2P51587 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRCA2P51587 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRCA2P51587 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRCA2P51587 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRCA2P51587 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRCA2P51587 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRCA2P51587 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRCA2P51587 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRCA2P51587 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
BRCA2P51587 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRCA2P51587 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRCA2P51587 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRCA2P51587 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRCA2P51587 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRCA2P51587 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRCA2P51587 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRCA2P51587 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRCA2P51587 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRCA2P51587 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRCA2P51587 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms