Protein–RNA interactions for Protein: P50613

CDK7, Cyclin-dependent kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK7P50613 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK7P50613 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK7P50613 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK7P50613 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK7P50613 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK7P50613 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK7P50613 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK7P50613 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK7P50613 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK7P50613 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK7P50613 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK7P50613 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK7P50613 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK7P50613 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK7P50613 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK7P50613 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK7P50613 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK7P50613 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK7P50613 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK7P50613 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK7P50613 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK7P50613 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK7P50613 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK7P50613 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK7P50613 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK7P50613 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK7P50613 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK7P50613 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK7P50613 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK7P50613 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK7P50613 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK7P50613 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK7P50613 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK7P50613 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK7P50613 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK7P50613 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK7P50613 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK7P50613 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK7P50613 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK7P50613 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK7P50613 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK7P50613 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK7P50613 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK7P50613 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK7P50613 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK7P50613 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDK7P50613 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDK7P50613 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDK7P50613 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDK7P50613 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK7P50613 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK7P50613 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK7P50613 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK7P50613 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK7P50613 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK7P50613 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK7P50613 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK7P50613 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK7P50613 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK7P50613 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK7P50613 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK7P50613 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK7P50613 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK7P50613 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK7P50613 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK7P50613 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK7P50613 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK7P50613 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK7P50613 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK7P50613 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK7P50613 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK7P50613 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK7P50613 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK7P50613 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK7P50613 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK7P50613 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK7P50613 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK7P50613 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK7P50613 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK7P50613 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK7P50613 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK7P50613 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK7P50613 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK7P50613 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK7P50613 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK7P50613 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK7P50613 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK7P50613 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK7P50613 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK7P50613 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK7P50613 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK7P50613 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK7P50613 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK7P50613 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK7P50613 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK7P50613 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK7P50613 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK7P50613 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK7P50613 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK7P50613 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms