Protein–RNA interactions for Protein: P50542

PEX5, Peroxisomal targeting signal 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX5P50542 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PEX5P50542 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PEX5P50542 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PEX5P50542 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PEX5P50542 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PEX5P50542 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PEX5P50542 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PEX5P50542 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PEX5P50542 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PEX5P50542 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PEX5P50542 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PEX5P50542 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PEX5P50542 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PEX5P50542 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PEX5P50542 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PEX5P50542 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PEX5P50542 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PEX5P50542 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PEX5P50542 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PEX5P50542 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PEX5P50542 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PEX5P50542 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PEX5P50542 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PEX5P50542 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PEX5P50542 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PEX5P50542 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PEX5P50542 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PEX5P50542 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PEX5P50542 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PEX5P50542 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PEX5P50542 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PEX5P50542 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PEX5P50542 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PEX5P50542 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PEX5P50542 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PEX5P50542 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PEX5P50542 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PEX5P50542 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PEX5P50542 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PEX5P50542 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PEX5P50542 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PEX5P50542 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PEX5P50542 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PEX5P50542 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PEX5P50542 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PEX5P50542 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PEX5P50542 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PEX5P50542 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PEX5P50542 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PEX5P50542 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PEX5P50542 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PEX5P50542 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PEX5P50542 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PEX5P50542 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PEX5P50542 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PEX5P50542 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PEX5P50542 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PEX5P50542 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PEX5P50542 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PEX5P50542 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PEX5P50542 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PEX5P50542 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PEX5P50542 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PEX5P50542 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PEX5P50542 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PEX5P50542 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PEX5P50542 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PEX5P50542 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PEX5P50542 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PEX5P50542 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PEX5P50542 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PEX5P50542 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PEX5P50542 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PEX5P50542 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PEX5P50542 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PEX5P50542 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PEX5P50542 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PEX5P50542 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PEX5P50542 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PEX5P50542 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PEX5P50542 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PEX5P50542 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PEX5P50542 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PEX5P50542 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PEX5P50542 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PEX5P50542 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PEX5P50542 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PEX5P50542 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PEX5P50542 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PEX5P50542 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PEX5P50542 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PEX5P50542 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PEX5P50542 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PEX5P50542 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PEX5P50542 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PEX5P50542 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PEX5P50542 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PEX5P50542 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PEX5P50542 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PEX5P50542 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms