Protein–RNA interactions for Protein: P50440

GATM, Glycine amidinotransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATMP50440 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GATMP50440 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GATMP50440 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GATMP50440 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GATMP50440 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GATMP50440 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GATMP50440 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GATMP50440 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GATMP50440 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GATMP50440 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GATMP50440 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GATMP50440 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GATMP50440 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GATMP50440 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GATMP50440 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GATMP50440 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GATMP50440 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GATMP50440 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GATMP50440 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GATMP50440 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GATMP50440 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GATMP50440 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GATMP50440 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GATMP50440 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GATMP50440 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GATMP50440 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GATMP50440 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GATMP50440 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GATMP50440 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GATMP50440 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GATMP50440 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GATMP50440 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GATMP50440 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GATMP50440 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GATMP50440 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GATMP50440 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GATMP50440 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GATMP50440 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GATMP50440 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GATMP50440 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GATMP50440 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GATMP50440 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GATMP50440 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GATMP50440 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GATMP50440 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GATMP50440 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GATMP50440 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GATMP50440 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GATMP50440 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GATMP50440 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GATMP50440 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GATMP50440 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GATMP50440 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GATMP50440 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GATMP50440 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GATMP50440 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GATMP50440 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GATMP50440 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GATMP50440 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GATMP50440 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GATMP50440 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GATMP50440 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GATMP50440 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GATMP50440 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GATMP50440 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GATMP50440 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GATMP50440 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GATMP50440 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GATMP50440 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GATMP50440 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GATMP50440 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GATMP50440 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GATMP50440 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GATMP50440 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GATMP50440 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GATMP50440 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GATMP50440 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GATMP50440 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GATMP50440 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GATMP50440 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GATMP50440 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GATMP50440 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GATMP50440 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GATMP50440 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GATMP50440 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GATMP50440 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GATMP50440 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GATMP50440 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GATMP50440 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GATMP50440 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GATMP50440 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GATMP50440 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GATMP50440 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GATMP50440 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GATMP50440 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GATMP50440 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GATMP50440 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GATMP50440 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GATMP50440 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GATMP50440 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms