Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSEN1P49768 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSEN1P49768 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSEN1P49768 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSEN1P49768 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSEN1P49768 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSEN1P49768 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSEN1P49768 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSEN1P49768 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSEN1P49768 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSEN1P49768 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSEN1P49768 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSEN1P49768 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSEN1P49768 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSEN1P49768 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSEN1P49768 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSEN1P49768 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PSEN1P49768 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSEN1P49768 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSEN1P49768 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PSEN1P49768 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSEN1P49768 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSEN1P49768 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PSEN1P49768 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSEN1P49768 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSEN1P49768 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSEN1P49768 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSEN1P49768 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSEN1P49768 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSEN1P49768 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSEN1P49768 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSEN1P49768 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSEN1P49768 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSEN1P49768 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSEN1P49768 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSEN1P49768 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PSEN1P49768 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSEN1P49768 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSEN1P49768 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSEN1P49768 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSEN1P49768 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSEN1P49768 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSEN1P49768 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSEN1P49768 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSEN1P49768 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSEN1P49768 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSEN1P49768 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSEN1P49768 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSEN1P49768 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSEN1P49768 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSEN1P49768 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSEN1P49768 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSEN1P49768 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSEN1P49768 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSEN1P49768 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSEN1P49768 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSEN1P49768 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSEN1P49768 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSEN1P49768 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSEN1P49768 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSEN1P49768 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSEN1P49768 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSEN1P49768 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSEN1P49768 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSEN1P49768 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSEN1P49768 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSEN1P49768 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSEN1P49768 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSEN1P49768 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSEN1P49768 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSEN1P49768 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSEN1P49768 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSEN1P49768 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSEN1P49768 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSEN1P49768 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PSEN1P49768 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSEN1P49768 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSEN1P49768 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSEN1P49768 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSEN1P49768 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSEN1P49768 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSEN1P49768 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSEN1P49768 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSEN1P49768 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSEN1P49768 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSEN1P49768 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSEN1P49768 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSEN1P49768 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSEN1P49768 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSEN1P49768 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSEN1P49768 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSEN1P49768 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSEN1P49768 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSEN1P49768 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSEN1P49768 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSEN1P49768 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSEN1P49768 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSEN1P49768 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSEN1P49768 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSEN1P49768 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms