Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FNTBP49356 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FNTBP49356 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FNTBP49356 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FNTBP49356 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FNTBP49356 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FNTBP49356 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FNTBP49356 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FNTBP49356 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FNTBP49356 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FNTBP49356 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FNTBP49356 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FNTBP49356 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FNTBP49356 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FNTBP49356 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FNTBP49356 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
FNTBP49356 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FNTBP49356 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FNTBP49356 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FNTBP49356 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FNTBP49356 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FNTBP49356 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FNTBP49356 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FNTBP49356 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FNTBP49356 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FNTBP49356 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FNTBP49356 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FNTBP49356 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FNTBP49356 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FNTBP49356 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FNTBP49356 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FNTBP49356 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FNTBP49356 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
FNTBP49356 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FNTBP49356 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
FNTBP49356 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
FNTBP49356 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FNTBP49356 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FNTBP49356 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FNTBP49356 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
FNTBP49356 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FNTBP49356 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FNTBP49356 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FNTBP49356 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FNTBP49356 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FNTBP49356 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FNTBP49356 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FNTBP49356 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FNTBP49356 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FNTBP49356 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FNTBP49356 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FNTBP49356 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FNTBP49356 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
FNTBP49356 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
FNTBP49356 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FNTBP49356 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FNTBP49356 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FNTBP49356 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
FNTBP49356 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FNTBP49356 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FNTBP49356 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FNTBP49356 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FNTBP49356 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FNTBP49356 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FNTBP49356 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FNTBP49356 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FNTBP49356 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
FNTBP49356 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FNTBP49356 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FNTBP49356 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FNTBP49356 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FNTBP49356 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FNTBP49356 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FNTBP49356 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FNTBP49356 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FNTBP49356 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FNTBP49356 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FNTBP49356 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FNTBP49356 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
FNTBP49356 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FNTBP49356 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FNTBP49356 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FNTBP49356 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FNTBP49356 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FNTBP49356 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FNTBP49356 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FNTBP49356 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FNTBP49356 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FNTBP49356 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FNTBP49356 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FNTBP49356 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FNTBP49356 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FNTBP49356 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FNTBP49356 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FNTBP49356 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FNTBP49356 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FNTBP49356 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
FNTBP49356 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FNTBP49356 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FNTBP49356 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms